130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4637 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  857    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  46.15 
 
 
442 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  46.34 
 
 
438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  43.45 
 
 
445 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  37.12 
 
 
432 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  33.42 
 
 
473 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  34.17 
 
 
445 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  34.66 
 
 
476 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  35.68 
 
 
477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  34.47 
 
 
470 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  33.65 
 
 
476 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  33.09 
 
 
437 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  33.42 
 
 
436 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  32.26 
 
 
459 aa  179  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  32.58 
 
 
482 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  31.78 
 
 
482 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  29.22 
 
 
467 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  34.98 
 
 
462 aa  173  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  32.92 
 
 
478 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  31.83 
 
 
480 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  31.75 
 
 
445 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  31.97 
 
 
488 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  32.52 
 
 
490 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  33.6 
 
 
436 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  34.15 
 
 
472 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  31.87 
 
 
481 aa  160  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  35.18 
 
 
447 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  33.33 
 
 
427 aa  159  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  33.25 
 
 
482 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  32.96 
 
 
465 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  28.74 
 
 
492 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  32.16 
 
 
482 aa  156  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  31.11 
 
 
480 aa  156  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  33.59 
 
 
480 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  32.65 
 
 
479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  32.9 
 
 
479 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  32.9 
 
 
479 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  32.35 
 
 
488 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  29.31 
 
 
462 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  31.44 
 
 
471 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  30.58 
 
 
480 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  31.5 
 
 
470 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  29.32 
 
 
484 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  29.78 
 
 
435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  28.15 
 
 
488 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  29.26 
 
 
512 aa  143  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  32.32 
 
 
479 aa  143  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  30.18 
 
 
461 aa  143  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  32.74 
 
 
423 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  25.92 
 
 
490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  31.8 
 
 
488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  26.13 
 
 
474 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  28.28 
 
 
465 aa  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  32.07 
 
 
473 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  28.36 
 
 
464 aa  126  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  27.38 
 
 
493 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  30.52 
 
 
470 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  40.94 
 
 
469 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  28.92 
 
 
478 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  41.25 
 
 
798 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  29.16 
 
 
473 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  29.16 
 
 
473 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  29.16 
 
 
432 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  28.5 
 
 
491 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  30.62 
 
 
475 aa  103  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  28.65 
 
 
478 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  28.65 
 
 
478 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  28.65 
 
 
478 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  28.49 
 
 
479 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  28.49 
 
 
479 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  28.4 
 
 
542 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  28.9 
 
 
473 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  28.9 
 
 
473 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  28.9 
 
 
473 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  28.9 
 
 
473 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  28.5 
 
 
487 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  43.97 
 
 
479 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  27.64 
 
 
465 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  24.38 
 
 
452 aa  93.6  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  27.58 
 
 
449 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  27.03 
 
 
472 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  25.24 
 
 
482 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  26.8 
 
 
459 aa  87.4  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  26.44 
 
 
456 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  24.81 
 
 
485 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  42.65 
 
 
479 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  40.28 
 
 
222 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  36.99 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  27.73 
 
 
451 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1114  protein of unknown function DUF1254  38.98 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6394  hypothetical protein  24.22 
 
 
491 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  38.81 
 
 
484 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  33.58 
 
 
431 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  26.43 
 
 
445 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1116  protein of unknown function DUF1254  36.28 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  34.81 
 
 
431 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  35 
 
 
467 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  36.7 
 
 
435 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  30.43 
 
 
499 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2605  protein of unknown function DUF1214  33.33 
 
 
291 aa  60.1  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461285  hitchhiker  0.000899244 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>