129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1113 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  59.46 
 
 		 222 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  54.14 
 
 		 482 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  51.22 
 
 		 482 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  43.85 
 
 		 478 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  44.3 
 
 		 472 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  43.6 
 
 		 459 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  41.01 
 
 		 470 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  39.78 
 
 		 445 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  40.8 
 
 		 464 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  41.62 
 
 		 445 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  39.46 
 
 		 490 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  43.48 
 
 		 477 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  43.12 
 
 		 476 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  42.17 
 
 		 435 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  39.13 
 
 		 462 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  39.38 
 
 		 436 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  37.97 
 
 		 488 aa  121  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  38.07 
 
 		 476 aa  117  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  42.68 
 
 		 482 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  46.21 
 
 		 479 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  37.43 
 
 		 436 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  35.91 
 
 		 465 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  40.13 
 
 		 492 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  38.61 
 
 		 490 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  35.87 
 
 		 437 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  38.61 
 
 		 484 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  38.61 
 
 		 469 aa  108  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  43.24 
 
 		 479 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  43.24 
 
 		 479 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  43.24 
 
 		 479 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  39.49 
 
 		 512 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  44.05 
 
 		 479 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  34.62 
 
 		 447 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  37.8 
 
 		 488 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  40.94 
 
 		 798 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  39.86 
 
 		 470 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  38.06 
 
 		 473 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  36.71 
 
 		 462 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  41.78 
 
 		 480 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  41.73 
 
 		 473 aa  101  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  40.7 
 
 		 480 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  36.9 
 
 		 445 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  41.1 
 
 		 480 aa  99.4  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  37.82 
 
 		 478 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  37.82 
 
 		 478 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  37.82 
 
 		 478 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  37.82 
 
 		 478 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  35.67 
 
 		 474 aa  99  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  38.71 
 
 		 488 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  38.17 
 
 		 471 aa  98.6  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  39.49 
 
 		 438 aa  98.6  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  33.93 
 
 		 542 aa  97.1  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  38.67 
 
 		 432 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  42.96 
 
 		 480 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  31.49 
 
 		 461 aa  96.3  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  35.67 
 
 		 479 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  35.67 
 
 		 479 aa  94.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  37.91 
 
 		 485 aa  94.4  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  37.79 
 
 		 481 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  34.44 
 
 		 470 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  36.71 
 
 		 475 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  35.03 
 
 		 465 aa  92.8  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  34.59 
 
 		 473 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  34.59 
 
 		 432 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  34.59 
 
 		 473 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  34.59 
 
 		 473 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  34.59 
 
 		 473 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  34.59 
 
 		 473 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  34.81 
 
 		 473 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  36.67 
 
 		 493 aa  91.7  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  38.46 
 
 		 467 aa  91.7  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  32.02 
 
 		 482 aa  90.9  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  37.98 
 
 		 479 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  34.69 
 
 		 484 aa  89.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  32.11 
 
 		 456 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  34.3 
 
 		 467 aa  89.4  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  32.34 
 
 		 427 aa  88.2  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  36.42 
 
 		 442 aa  88.2  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  36.08 
 
 		 465 aa  85.1  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  32.52 
 
 		 487 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  32.72 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  33.33 
 
 		 452 aa  82.8  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  33.33 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  37.3 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  31.52 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  33.96 
 
 		 459 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2605  protein of unknown function DUF1214  33.73 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461285  hitchhiker  0.000899244 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  32 
 
 		 449 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  36.99 
 
 		 421 aa  78.2  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  41.59 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  34.48 
 
 		 488 aa  75.1  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  33.73 
 
 		 451 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  32.77 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  32.77 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  32.8 
 
 		 435 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  34.4 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  34.62 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  30.4 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  36.11 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>