128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5158 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  987    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  88.33 
 
 		 480 aa  882    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  55.48 
 
 		 798 aa  497  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  56.11 
 
 		 470 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  51.42 
 
 		 479 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  51.74 
 
 		 480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  50.52 
 
 		 479 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  50.52 
 
 		 479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  50.52 
 
 		 479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  49.33 
 
 		 471 aa  441  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  47.19 
 
 		 481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  46.14 
 
 		 480 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  48.86 
 
 		 488 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  44.51 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  38.95 
 
 		 467 aa  332  7.000000000000001e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  35.38 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  34.85 
 
 		 476 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  34.08 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  31.6 
 
 		 473 aa  243  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  33.63 
 
 		 459 aa  232  9e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  35.12 
 
 		 476 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  32.9 
 
 		 488 aa  231  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  34.72 
 
 		 478 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  32.38 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  32.06 
 
 		 490 aa  225  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  33.56 
 
 		 482 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  33.48 
 
 		 482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  32.91 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  33.33 
 
 		 477 aa  211  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  30.6 
 
 		 445 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  30.79 
 
 		 435 aa  193  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  32.33 
 
 		 447 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  30.39 
 
 		 465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  32.91 
 
 		 462 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  29.78 
 
 		 490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  28.99 
 
 		 461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  32.91 
 
 		 438 aa  180  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  32.04 
 
 		 435 aa  179  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  29.93 
 
 		 488 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  30.09 
 
 		 431 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  29.37 
 
 		 465 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  30.02 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  28.86 
 
 		 493 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  29.91 
 
 		 512 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  32.03 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  30.11 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  29 
 
 		 431 aa  167  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  29.93 
 
 		 437 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  28.98 
 
 		 436 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  28.87 
 
 		 474 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  30.37 
 
 		 473 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  29.39 
 
 		 462 aa  163  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  29.85 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  27.96 
 
 		 492 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  28.71 
 
 		 488 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  30.51 
 
 		 485 aa  154  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  28.89 
 
 		 482 aa  154  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  30.58 
 
 		 421 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  30.37 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  29.09 
 
 		 432 aa  149  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  29.02 
 
 		 427 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  28.57 
 
 		 469 aa  147  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  27.27 
 
 		 487 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  28.54 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  26.98 
 
 		 491 aa  140  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  29 
 
 		 423 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  27.85 
 
 		 467 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  27.97 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  28.29 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  28.29 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  27.98 
 
 		 482 aa  134  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  28.45 
 
 		 473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  27.35 
 
 		 484 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  28.45 
 
 		 473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  28.45 
 
 		 473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  28.45 
 
 		 473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  27.68 
 
 		 465 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  26.51 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  28.19 
 
 		 478 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  28.19 
 
 		 478 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  28.29 
 
 		 478 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  26.69 
 
 		 542 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  26.75 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  27.53 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  27.79 
 
 		 475 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  28.48 
 
 		 478 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  28.48 
 
 		 479 aa  120  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6394  hypothetical protein  25.85 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  41.1 
 
 		 200 aa  99.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  25.41 
 
 		 445 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  25 
 
 		 512 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  33.82 
 
 		 222 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5641  hypothetical protein  27.8 
 
 		 465 aa  90.1  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.617076 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  25.33 
 
 		 449 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  26.28 
 
 		 452 aa  89.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  26.29 
 
 		 506 aa  87  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  25.18 
 
 		 459 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0604  hypothetical protein  24.48 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  27.94 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3037  hypothetical protein  23.37 
 
 		 496 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>