143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6753 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  983    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  82.99 
 
 		 482 aa  837    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  59.38 
 
 		 477 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  51.5 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  50.41 
 
 		 482 aa  448  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  48.62 
 
 		 478 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  47.58 
 
 		 459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  46.21 
 
 		 445 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  46.54 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  47.15 
 
 		 476 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  45.83 
 
 		 470 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  43.86 
 
 		 488 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  43.99 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  44.24 
 
 		 472 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  46.01 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  39.36 
 
 		 462 aa  318  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  45.04 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  33.55 
 
 		 473 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  34.72 
 
 		 491 aa  256  9e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  35.1 
 
 		 487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  33.76 
 
 		 542 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  35.81 
 
 		 492 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  36.02 
 
 		 488 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  32.88 
 
 		 493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  33.63 
 
 		 471 aa  233  5e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  30.84 
 
 		 490 aa  230  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  33.86 
 
 		 512 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  34.6 
 
 		 480 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  32.37 
 
 		 484 aa  224  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  33.94 
 
 		 798 aa  223  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  33.48 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  33.19 
 
 		 442 aa  221  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  30.25 
 
 		 474 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  33.91 
 
 		 479 aa  219  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  33.93 
 
 		 481 aa  219  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  32.81 
 
 		 480 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  34.75 
 
 		 480 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  34.09 
 
 		 470 aa  217  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  31.65 
 
 		 469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  33.85 
 
 		 432 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  33.95 
 
 		 479 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  31.66 
 
 		 488 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  33.18 
 
 		 470 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  33.92 
 
 		 445 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  32.51 
 
 		 472 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  36.09 
 
 		 447 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  34.05 
 
 		 479 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  33.92 
 
 		 479 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  33.92 
 
 		 479 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  32.24 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  31.78 
 
 		 465 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  29.64 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  31.4 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  31.13 
 
 		 479 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  30.28 
 
 		 432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  30.3 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  30.3 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  30.28 
 
 		 473 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  30.28 
 
 		 473 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  31.31 
 
 		 479 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  31.59 
 
 		 465 aa  196  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  32.04 
 
 		 437 aa  196  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  30.3 
 
 		 478 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  30.05 
 
 		 473 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  30.05 
 
 		 473 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  30.05 
 
 		 473 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  30.05 
 
 		 473 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  30.11 
 
 		 461 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  31.49 
 
 		 465 aa  192  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  32.14 
 
 		 438 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  30.32 
 
 		 488 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  29.44 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  30.27 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  30.27 
 
 		 484 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  30.86 
 
 		 485 aa  188  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  31.95 
 
 		 427 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  30.79 
 
 		 475 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  31.31 
 
 		 435 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  31.29 
 
 		 464 aa  183  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  32.58 
 
 		 421 aa  178  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  31.7 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  54.14 
 
 		 200 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  48.82 
 
 		 222 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  27.59 
 
 		 467 aa  150  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  30.79 
 
 		 479 aa  149  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  27.52 
 
 		 435 aa  143  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  27.17 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  31.07 
 
 		 449 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  28.28 
 
 		 431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  27.11 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  26.49 
 
 		 482 aa  126  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  28.98 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  29.87 
 
 		 445 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  28.98 
 
 		 456 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  26.67 
 
 		 459 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  25.74 
 
 		 480 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  25.74 
 
 		 480 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3030  hypothetical protein  25.58 
 
 		 495 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2579  hypothetical protein  22.87 
 
 		 512 aa  89.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0592  hypothetical protein  23.94 
 
 		 511 aa  86.7  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.930976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>