117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4778 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  94.77 
 
 		 478 aa  880    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  99.37 
 
 		 478 aa  948    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  90.4 
 
 		 479 aa  838    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  99.37 
 
 		 478 aa  948    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  87.45 
 
 		 475 aa  796    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  951    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  92.28 
 
 		 479 aa  867    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  69.38 
 
 		 473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  69.38 
 
 		 473 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  68.75 
 
 		 473 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  68.75 
 
 		 473 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  68.75 
 
 		 473 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  68.75 
 
 		 473 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  68.56 
 
 		 432 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  67.15 
 
 		 484 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  58.37 
 
 		 470 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  60.81 
 
 		 465 aa  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  59.5 
 
 		 472 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  38.09 
 
 		 470 aa  293  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  37.32 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  37.64 
 
 		 476 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  35.97 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  35.14 
 
 		 478 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  33.18 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  34.91 
 
 		 476 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  33.63 
 
 		 459 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  33.06 
 
 		 491 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  34.17 
 
 		 462 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  33.68 
 
 		 487 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  34.66 
 
 		 436 aa  209  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  32.2 
 
 		 482 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  30.6 
 
 		 482 aa  203  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  30.82 
 
 		 490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  31.28 
 
 		 488 aa  200  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  29.07 
 
 		 493 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  32.88 
 
 		 542 aa  192  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  30.58 
 
 		 477 aa  180  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  30.48 
 
 		 482 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  31.82 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  28.79 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  28.15 
 
 		 473 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  31.33 
 
 		 442 aa  150  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  30.68 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  30.34 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  29.14 
 
 		 798 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  31.07 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  28.22 
 
 		 471 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  30.14 
 
 		 479 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  26.56 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  31.14 
 
 		 469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  28.94 
 
 		 492 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  29.1 
 
 		 480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  27.46 
 
 		 480 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  28.69 
 
 		 480 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  27.62 
 
 		 470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  30.14 
 
 		 479 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  29.86 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  29.86 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  31.81 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  29.63 
 
 		 488 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  28.24 
 
 		 481 aa  127  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  29.62 
 
 		 480 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  29.74 
 
 		 482 aa  123  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  26.86 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  29.34 
 
 		 512 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  26.74 
 
 		 467 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  27.81 
 
 		 474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  27.31 
 
 		 462 aa  120  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  26.62 
 
 		 464 aa  120  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  26.76 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  27.48 
 
 		 482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  28.6 
 
 		 465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  28.38 
 
 		 488 aa  114  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  31.02 
 
 		 447 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  27.65 
 
 		 436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  28.03 
 
 		 431 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  26.89 
 
 		 465 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  29.65 
 
 		 421 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  29.09 
 
 		 431 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  28.15 
 
 		 437 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  28.18 
 
 		 427 aa  103  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  29.24 
 
 		 435 aa  103  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  28.38 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  25.97 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  23.82 
 
 		 461 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  25.31 
 
 		 449 aa  100  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  37.82 
 
 		 200 aa  99.8  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  39.1 
 
 		 222 aa  94  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  27.57 
 
 		 479 aa  90.5  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  27.51 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  23.13 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2605  protein of unknown function DUF1214  32.94 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461285  hitchhiker  0.000899244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  24.14 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  24.14 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  34.06 
 
 		 466 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  23.41 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  33.81 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  24.47 
 
 		 506 aa  67.4  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  30.86 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1116  protein of unknown function DUF1254  29.24 
 
 		 191 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>