146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1631 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  100 
 
 		 798 aa  1636    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  62.36 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  61.22 
 
 		 480 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  61.16 
 
 		 479 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  61.42 
 
 		 479 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  61.42 
 
 		 479 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  59.82 
 
 		 479 aa  561  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  55.48 
 
 		 480 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  55.76 
 
 		 480 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5225  hypothetical protein  72.2 
 
 		 348 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582161  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5159  hypothetical protein  71.34 
 
 		 344 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  49.36 
 
 		 471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  50.22 
 
 		 481 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  49.24 
 
 		 488 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  51.12 
 
 		 479 aa  419  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  47.76 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2722  hypothetical protein  59.87 
 
 		 318 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198072 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5466  hypothetical protein  58.15 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1293  protein of unknown function DUF1214  57.32 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282416  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  42.79 
 
 		 467 aa  365  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1476  protein of unknown function DUF1214  54.34 
 
 		 336 aa  348  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1083  protein of unknown function DUF1214  53.05 
 
 		 347 aa  347  4e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1345  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0734  protein of unknown function DUF1214  45.78 
 
 		 314 aa  274  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  38.03 
 
 		 476 aa  272  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  37.53 
 
 		 459 aa  257  7e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  35.31 
 
 		 490 aa  248  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  35.23 
 
 		 473 aa  247  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  36.17 
 
 		 488 aa  247  6.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  34.77 
 
 		 482 aa  247  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  34.35 
 
 		 445 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  37.23 
 
 		 478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  33.79 
 
 		 482 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  34.4 
 
 		 482 aa  232  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  33.86 
 
 		 477 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  32.35 
 
 		 470 aa  226  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  31.78 
 
 		 445 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  34.1 
 
 		 476 aa  221  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  33.12 
 
 		 472 aa  221  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3687  hypothetical protein  61.45 
 
 		 166 aa  219  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  34.62 
 
 		 447 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  33.83 
 
 		 462 aa  198  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  31.32 
 
 		 488 aa  194  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  33.55 
 
 		 512 aa  191  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  32.59 
 
 		 442 aa  190  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  31.35 
 
 		 436 aa  189  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  31.79 
 
 		 462 aa  185  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  32.02 
 
 		 488 aa  184  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  30.16 
 
 		 436 aa  180  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3690  hypothetical protein  56.94 
 
 		 151 aa  180  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  29.96 
 
 		 492 aa  179  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  31.91 
 
 		 438 aa  177  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  31.94 
 
 		 445 aa  177  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  28.6 
 
 		 461 aa  177  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03471  hypothetical protein  35.71 
 
 		 354 aa  174  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  30.11 
 
 		 437 aa  174  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  29.39 
 
 		 465 aa  173  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  31.56 
 
 		 484 aa  171  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  29 
 
 		 490 aa  171  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  29.96 
 
 		 435 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  29.39 
 
 		 474 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1118  hypothetical protein  34.69 
 
 		 370 aa  167  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0540786  normal  0.375546 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  29.8 
 
 		 493 aa  162  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  26.64 
 
 		 465 aa  160  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  27.52 
 
 		 469 aa  160  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0555  hypothetical protein  30.82 
 
 		 325 aa  159  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311779  normal  0.0765605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  29.51 
 
 		 473 aa  159  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  28.72 
 
 		 431 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  28.75 
 
 		 482 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  26.51 
 
 		 435 aa  151  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  27.73 
 
 		 464 aa  151  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  30.15 
 
 		 465 aa  145  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  27.67 
 
 		 432 aa  144  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  28.2 
 
 		 431 aa  144  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  28.24 
 
 		 427 aa  141  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  27.76 
 
 		 485 aa  140  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  28.84 
 
 		 472 aa  139  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  29.09 
 
 		 470 aa  137  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  29.27 
 
 		 478 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  29.27 
 
 		 478 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  27.18 
 
 		 487 aa  135  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  29.36 
 
 		 478 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  26.27 
 
 		 491 aa  133  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6674  soluble lytic murein transglycosylase  31.42 
 
 		 339 aa  131  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  28.71 
 
 		 423 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  28.92 
 
 		 479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  28.3 
 
 		 479 aa  129  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  27.12 
 
 		 479 aa  126  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  27.8 
 
 		 542 aa  122  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  26.17 
 
 		 432 aa  122  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  26.4 
 
 		 473 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  26.17 
 
 		 473 aa  121  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  24.3 
 
 		 482 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  28.1 
 
 		 478 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  27.56 
 
 		 475 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  26.17 
 
 		 473 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  26.17 
 
 		 473 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  26.17 
 
 		 473 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  26.17 
 
 		 473 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  25.91 
 
 		 467 aa  117  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  25.61 
 
 		 484 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>