94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3687 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3687  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  332  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2722  hypothetical protein  77.51 
 
 		 318 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198072 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5225  hypothetical protein  61.82 
 
 		 348 aa  223  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582161  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5159  hypothetical protein  62.65 
 
 		 344 aa  224  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  61.45 
 
 		 798 aa  219  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1476  protein of unknown function DUF1214  55.76 
 
 		 336 aa  205  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5466  hypothetical protein  60 
 
 		 375 aa  204  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1083  protein of unknown function DUF1214  55.15 
 
 		 347 aa  202  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1345  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1293  protein of unknown function DUF1214  57.83 
 
 		 345 aa  193  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282416  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0734  protein of unknown function DUF1214  47.8 
 
 		 314 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0555  hypothetical protein  38.13 
 
 		 325 aa  101  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311779  normal  0.0765605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03471  hypothetical protein  38.4 
 
 		 354 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1118  hypothetical protein  36.69 
 
 		 370 aa  87  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0540786  normal  0.375546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2034  hypothetical protein  42.25 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  35.76 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  32.45 
 
 		 482 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  35.51 
 
 		 482 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  34.69 
 
 		 427 aa  61.6  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  35.97 
 
 		 477 aa  61.2  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  34.18 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  33.33 
 
 		 476 aa  58.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  33.82 
 
 		 445 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  43.48 
 
 		 473 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  33.33 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  29.32 
 
 		 445 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  31.29 
 
 		 493 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  34.78 
 
 		 447 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  40.45 
 
 		 512 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  31.79 
 
 		 478 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  35.24 
 
 		 469 aa  55.1  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0844  putative lipoprotein  29.17 
 
 		 360 aa  53.9  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  37.21 
 
 		 435 aa  53.9  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  31.21 
 
 		 436 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  31.88 
 
 		 472 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  29.25 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  31.61 
 
 		 432 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  32.54 
 
 		 462 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  33.65 
 
 		 466 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  33.06 
 
 		 492 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  28.76 
 
 		 452 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5651  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  27.91 
 
 		 467 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  37.21 
 
 		 437 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  32.37 
 
 		 470 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  33.09 
 
 		 459 aa  52  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  35.96 
 
 		 464 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  30.67 
 
 		 488 aa  51.2  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  32.39 
 
 		 471 aa  51.2  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  35.87 
 
 		 484 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  36.96 
 
 		 488 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  33.71 
 
 		 490 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  30.43 
 
 		 470 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  38.64 
 
 		 465 aa  48.5  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  34.09 
 
 		 491 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  30.88 
 
 		 462 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6394  hypothetical protein  29.8 
 
 		 491 aa  48.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  31.5 
 
 		 465 aa  48.5  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  28.47 
 
 		 461 aa  48.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  37.65 
 
 		 470 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  30.52 
 
 		 479 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  35.29 
 
 		 480 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  30.43 
 
 		 479 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  32.19 
 
 		 480 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  30.43 
 
 		 479 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  35.29 
 
 		 480 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  30.43 
 
 		 479 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  34.55 
 
 		 479 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  34.09 
 
 		 474 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0604  hypothetical protein  32.43 
 
 		 457 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02425  hypothetical protein  32.48 
 
 		 518 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  41.98 
 
 		 480 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  31.25 
 
 		 445 aa  44.7  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  34.09 
 
 		 488 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  28.97 
 
 		 191 aa  44.7  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6674  soluble lytic murein transglycosylase  26.9 
 
 		 339 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  31.43 
 
 		 482 aa  44.3  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0592  hypothetical protein  36 
 
 		 511 aa  44.3  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.930976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3055  hypothetical protein  32.93 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  34.41 
 
 		 421 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  32.56 
 
 		 436 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1149  hypothetical protein  27.87 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  33.68 
 
 		 467 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  27.81 
 
 		 431 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2579  hypothetical protein  30.47 
 
 		 512 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  32.79 
 
 		 442 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  37 
 
 		 512 aa  43.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  35.87 
 
 		 479 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  30.26 
 
 		 506 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1410  hypothetical protein  32.93 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  32.22 
 
 		 480 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  34.78 
 
 		 488 aa  42  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  30.56 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  31.46 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0593  hypothetical protein  30.77 
 
 		 499 aa  41.2  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>