115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3918 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  100 
 
 		 512 aa  1040    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0604  hypothetical protein  60.39 
 
 		 457 aa  581  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2579  hypothetical protein  45.02 
 
 		 512 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02425  hypothetical protein  45.09 
 
 		 518 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0264  hypothetical protein  41.7 
 
 		 538 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.11203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04201  hypothetical protein  38.07 
 
 		 507 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04191  hypothetical protein  40.82 
 
 		 515 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0910  hypothetical protein  38.95 
 
 		 517 aa  323  5e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.190364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  37.69 
 
 		 506 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  35.03 
 
 		 512 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3839  protein of unknown function DUF1254  36.26 
 
 		 476 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190359  normal  0.11168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0592  hypothetical protein  35.74 
 
 		 511 aa  276  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.930976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3030  hypothetical protein  34.82 
 
 		 495 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3284  hypothetical protein  37.47 
 
 		 493 aa  270  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133196  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  35.6 
 
 		 491 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  34.73 
 
 		 466 aa  250  5e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  35.14 
 
 		 480 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  35.14 
 
 		 480 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5641  hypothetical protein  36.08 
 
 		 465 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.617076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0593  hypothetical protein  30.85 
 
 		 499 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3037  hypothetical protein  31.77 
 
 		 496 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533722  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  30.79 
 
 		 499 aa  203  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  26.21 
 
 		 473 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  26.37 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  26.48 
 
 		 465 aa  96.7  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  25.13 
 
 		 488 aa  96.3  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  25 
 
 		 480 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  24.12 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  25.31 
 
 		 470 aa  92  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  25.16 
 
 		 476 aa  90.9  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  24.75 
 
 		 461 aa  90.5  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  25.51 
 
 		 442 aa  89.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  23.7 
 
 		 476 aa  87.8  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  23.45 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  24.84 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  23.21 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  26.12 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  26.49 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  23.3 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  23.67 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  23.25 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  25.11 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  23.16 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  22.8 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  23.67 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  24.43 
 
 		 470 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  22.61 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  23.61 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  23.62 
 
 		 512 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  27.04 
 
 		 480 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  25 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  25 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  25 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  21.79 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  23.96 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  23.25 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  21.45 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  23.57 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  23.33 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  23.1 
 
 		 479 aa  67  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  24.28 
 
 		 435 aa  67  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  22.86 
 
 		 475 aa  67  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  24.31 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  23.13 
 
 		 798 aa  65.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  23.46 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  22.65 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  23.08 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  23.29 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  21.56 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  25.55 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  25.24 
 
 		 488 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  21.89 
 
 		 487 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  23.18 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  20.93 
 
 		 484 aa  62  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  22.67 
 
 		 491 aa  62  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  20.81 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  20.81 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  20.81 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  22.02 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  24.44 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  20.58 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  21.89 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  21.69 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  20.58 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  20.58 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  20.58 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  22.57 
 
 		 488 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  21.73 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  21.73 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  29.27 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  21.76 
 
 		 462 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  21.5 
 
 		 482 aa  54.7  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  30.36 
 
 		 484 aa  54.3  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  22.79 
 
 		 447 aa  53.5  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  32.35 
 
 		 437 aa  53.5  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  21.88 
 
 		 470 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  30 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  22.75 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  23.63 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  22.44 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>