127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3377 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  100 
 
 		 499 aa  1028    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  34.73 
 
 		 491 aa  267  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0593  hypothetical protein  31.11 
 
 		 499 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0604  hypothetical protein  31.17 
 
 		 457 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  30.79 
 
 		 512 aa  203  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  31.05 
 
 		 506 aa  200  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0910  hypothetical protein  31.52 
 
 		 517 aa  195  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.190364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02425  hypothetical protein  27.87 
 
 		 518 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04191  hypothetical protein  30.39 
 
 		 515 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2579  hypothetical protein  28.4 
 
 		 512 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  30.35 
 
 		 466 aa  170  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04201  hypothetical protein  30.48 
 
 		 507 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3284  hypothetical protein  30.59 
 
 		 493 aa  162  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3839  protein of unknown function DUF1254  28.12 
 
 		 476 aa  158  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190359  normal  0.11168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3030  hypothetical protein  26.18 
 
 		 495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  26.15 
 
 		 512 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0264  hypothetical protein  25.83 
 
 		 538 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.11203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0592  hypothetical protein  27.46 
 
 		 511 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.930976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3037  hypothetical protein  27.65 
 
 		 496 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5641  hypothetical protein  28.73 
 
 		 465 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.617076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  26.75 
 
 		 480 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  26.75 
 
 		 480 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  26.52 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  26.12 
 
 		 461 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  23.94 
 
 		 473 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  30.65 
 
 		 485 aa  96.3  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  24.69 
 
 		 467 aa  87.8  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  27.32 
 
 		 471 aa  86.7  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  24.12 
 
 		 482 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  24.82 
 
 		 472 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  27.94 
 
 		 480 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  28.06 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  25.22 
 
 		 480 aa  80.1  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  22.96 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  27.39 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  29.55 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  30.89 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  25.12 
 
 		 480 aa  77  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  23.5 
 
 		 482 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  29.87 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  34.69 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  31.62 
 
 		 512 aa  73.6  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  28.03 
 
 		 459 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  26.09 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  26.09 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  24.71 
 
 		 490 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  26.09 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  30.4 
 
 		 445 aa  73.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  36.7 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  33.61 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  25.25 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  23.88 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  35 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  33.11 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  24.94 
 
 		 470 aa  70.1  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  24.5 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  32 
 
 		 442 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  24.69 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  24.92 
 
 		 482 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  25.49 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  25.07 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  31.25 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  34.75 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  34.45 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  34.11 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  26.85 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  31.36 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  30.61 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  34.35 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  29.29 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  35.65 
 
 		 459 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  25.99 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  26.97 
 
 		 484 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  30.43 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  26.2 
 
 		 481 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  27.16 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  29.46 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  21.69 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  31.82 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  31.62 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  21.85 
 
 		 467 aa  60.1  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  28.57 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  31.06 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  27.89 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  24.88 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  31.5 
 
 		 798 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  32.43 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  30.66 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  31.19 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  32.11 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  32.11 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  31.19 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  32.11 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  24.25 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  32.11 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  32.11 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  27.52 
 
 		 474 aa  57  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  33.04 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  32.71 
 
 		 192 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  37.89 
 
 		 488 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>