83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5641 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5641  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  952    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.617076 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  52.26 
 
 		 480 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  52.26 
 
 		 480 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  47.37 
 
 		 466 aa  425  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3037  hypothetical protein  35.92 
 
 		 496 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  36.08 
 
 		 512 aa  241  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0604  hypothetical protein  34.11 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02425  hypothetical protein  34 
 
 		 518 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2579  hypothetical protein  34.54 
 
 		 512 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  32.3 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04201  hypothetical protein  33.02 
 
 		 507 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  33.04 
 
 		 512 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0592  hypothetical protein  31.34 
 
 		 511 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.930976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04191  hypothetical protein  34.67 
 
 		 515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  30.65 
 
 		 491 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3030  hypothetical protein  29.25 
 
 		 495 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0264  hypothetical protein  29 
 
 		 538 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.11203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0910  hypothetical protein  33.96 
 
 		 517 aa  154  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.190364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3284  hypothetical protein  33.14 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3839  protein of unknown function DUF1254  29.01 
 
 		 476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190359  normal  0.11168 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  28.73 
 
 		 499 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0593  hypothetical protein  28.03 
 
 		 499 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  26.82 
 
 		 473 aa  90.5  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  27.8 
 
 		 480 aa  90.1  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  24.84 
 
 		 480 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  24.49 
 
 		 479 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  26.28 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  25.8 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  24.59 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  25.13 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  22.86 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  25.12 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  23.64 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  25.06 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  25.06 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  26.16 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  23.51 
 
 		 490 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  23.08 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  24.54 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  23.2 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  24.8 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  22.48 
 
 		 432 aa  67  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  24.88 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  21.86 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  24.42 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  24.02 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  25.64 
 
 		 479 aa  63.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  22.94 
 
 		 445 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  26.69 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  22.69 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  23.46 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  24.35 
 
 		 482 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  32.79 
 
 		 485 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  23.12 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  25.53 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  23.54 
 
 		 512 aa  55.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  34.83 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  25.34 
 
 		 488 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  22.46 
 
 		 470 aa  54.7  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  25.72 
 
 		 482 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  23.52 
 
 		 798 aa  53.9  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  21.26 
 
 		 464 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  24.12 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  22.04 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  30.48 
 
 		 456 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  34.02 
 
 		 447 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  20.94 
 
 		 490 aa  50.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  21.5 
 
 		 482 aa  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  22.67 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  31.18 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  21.37 
 
 		 437 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  22.64 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  22.42 
 
 		 491 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  27.05 
 
 		 465 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  22.15 
 
 		 470 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  32.98 
 
 		 222 aa  47.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  26.02 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  21.96 
 
 		 487 aa  47  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  22.89 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  19.54 
 
 		 452 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  20.67 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  31.18 
 
 		 200 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  29.7 
 
 		 469 aa  44.3  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>