116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6665 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  100 
 
 		 512 aa  1048    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0592  hypothetical protein  57.84 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.930976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  45.44 
 
 		 506 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02425  hypothetical protein  34.1 
 
 		 518 aa  300  6e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3839  protein of unknown function DUF1254  36.23 
 
 		 476 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190359  normal  0.11168 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  35.03 
 
 		 512 aa  290  4e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3030  hypothetical protein  37.37 
 
 		 495 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0604  hypothetical protein  38.88 
 
 		 457 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2579  hypothetical protein  34.58 
 
 		 512 aa  288  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0264  hypothetical protein  32.88 
 
 		 538 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.11203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04201  hypothetical protein  33.13 
 
 		 507 aa  246  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3284  hypothetical protein  34.74 
 
 		 493 aa  240  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  32.7 
 
 		 480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  32.7 
 
 		 480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  31.42 
 
 		 466 aa  206  9e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  29.26 
 
 		 491 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0593  hypothetical protein  29.5 
 
 		 499 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5641  hypothetical protein  33.04 
 
 		 465 aa  193  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.617076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3037  hypothetical protein  29.28 
 
 		 496 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04191  hypothetical protein  30.74 
 
 		 515 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0910  hypothetical protein  30.37 
 
 		 517 aa  182  9.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.190364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  26.15 
 
 		 499 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  26.46 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  24.49 
 
 		 461 aa  98.2  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  26.06 
 
 		 488 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  24.02 
 
 		 445 aa  93.6  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  25.89 
 
 		 512 aa  91.3  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  24.61 
 
 		 476 aa  90.9  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  24.49 
 
 		 484 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  25.18 
 
 		 472 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  23.58 
 
 		 445 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  26.33 
 
 		 467 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  25.73 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  26.67 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  25.24 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  25.05 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  23.67 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  26.43 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  26.29 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  22.88 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  23.39 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  26.21 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  24.85 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  24.85 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  24.85 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  24.85 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  25.12 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  36.64 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  24.95 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  23.85 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  24.64 
 
 		 473 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  23.93 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  23.94 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  32.87 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  25.62 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  24.58 
 
 		 479 aa  74.7  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  24.3 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  37.69 
 
 		 798 aa  73.6  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  26.38 
 
 		 470 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  23.62 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  34.33 
 
 		 488 aa  71.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  22.87 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  23.94 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  32.59 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  22.31 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  24.29 
 
 		 488 aa  69.7  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  22.24 
 
 		 462 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  34.68 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  37.01 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  36.67 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  25.97 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  33.82 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  23.8 
 
 		 447 aa  67  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  35.38 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  34.88 
 
 		 482 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  29.02 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  37.19 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  23.45 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  34.78 
 
 		 479 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  33.09 
 
 		 485 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  34.78 
 
 		 479 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  35.65 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  22.81 
 
 		 479 aa  62  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  32.77 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  35.82 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  35.82 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  35.82 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  35.83 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  22.08 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  32.77 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  32.26 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  35.94 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  31.25 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  33.08 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  33.61 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  33.61 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  33.61 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  30.3 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  20.9 
 
 		 473 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  22.44 
 
 		 462 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>