93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0593 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0593  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  1018    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  35.62 
 
 		 491 aa  286  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  30.86 
 
 		 499 aa  227  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  30.83 
 
 		 512 aa  225  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0604  hypothetical protein  31.56 
 
 		 457 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  32.13 
 
 		 506 aa  217  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2579  hypothetical protein  30.25 
 
 		 512 aa  213  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04201  hypothetical protein  30.15 
 
 		 507 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3284  hypothetical protein  32.2 
 
 		 493 aa  203  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133196  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02425  hypothetical protein  29.01 
 
 		 518 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  29.5 
 
 		 512 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0592  hypothetical protein  29.91 
 
 		 511 aa  187  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.930976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0264  hypothetical protein  27.41 
 
 		 538 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.11203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0910  hypothetical protein  28.99 
 
 		 517 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.190364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04191  hypothetical protein  28.85 
 
 		 515 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  29.61 
 
 		 466 aa  170  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3030  hypothetical protein  26.32 
 
 		 495 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  29.45 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  29.45 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3839  protein of unknown function DUF1254  26.29 
 
 		 476 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190359  normal  0.11168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3037  hypothetical protein  27.71 
 
 		 496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5641  hypothetical protein  28.03 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.617076 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  23.08 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  22.81 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  25 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  22.7 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  34.43 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  33.85 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  23.76 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  22.98 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  30.61 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  22.35 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  23.09 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  29.82 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  23.3 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  36.89 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  35.71 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  31.39 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  33.33 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  30.33 
 
 		 493 aa  57  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  25.44 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  31.91 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  24.38 
 
 		 482 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  34.78 
 
 		 478 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  34.78 
 
 		 478 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  32.5 
 
 		 472 aa  54.3  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  34.78 
 
 		 478 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  25.62 
 
 		 488 aa  53.9  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  32.46 
 
 		 479 aa  53.5  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  33.04 
 
 		 479 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  30 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  22.11 
 
 		 480 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  31.4 
 
 		 423 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  27.91 
 
 		 467 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  33.58 
 
 		 479 aa  51.2  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  29.17 
 
 		 472 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  32.5 
 
 		 478 aa  50.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  27.68 
 
 		 485 aa  50.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  24.6 
 
 		 482 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  30.17 
 
 		 470 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  30.22 
 
 		 492 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  23.91 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  30.25 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  22.53 
 
 		 480 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  34.48 
 
 		 475 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  29.41 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  29.1 
 
 		 490 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  22.32 
 
 		 478 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  23.93 
 
 		 480 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  28.1 
 
 		 438 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  22.57 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  22.13 
 
 		 459 aa  48.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  21.09 
 
 		 476 aa  47.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  31.4 
 
 		 222 aa  47.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  29.41 
 
 		 200 aa  47.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  26.89 
 
 		 476 aa  47  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  31.9 
 
 		 490 aa  47  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  22.83 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  28.69 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  28.33 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  31.03 
 
 		 436 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  22.09 
 
 		 431 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2722  hypothetical protein  33.06 
 
 		 318 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  29.17 
 
 		 467 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  28.33 
 
 		 473 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  28.33 
 
 		 473 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  28.33 
 
 		 473 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  28.33 
 
 		 473 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  28.33 
 
 		 473 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  28.33 
 
 		 432 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  30 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  28.33 
 
 		 473 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  25.87 
 
 		 474 aa  43.9  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>