117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5367 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  94.35 
 
 
478 aa  877    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  100 
 
 
478 aa  955    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  89.77 
 
 
479 aa  833    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  100 
 
 
478 aa  955    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  87.03 
 
 
475 aa  792    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  99.37 
 
 
478 aa  948    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  91.65 
 
 
479 aa  862    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  68.96 
 
 
473 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  68.96 
 
 
473 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  68.33 
 
 
473 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  68.33 
 
 
473 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  68.33 
 
 
473 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  68.33 
 
 
473 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  68.11 
 
 
432 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  66.74 
 
 
484 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  57.95 
 
 
470 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  60.38 
 
 
465 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  59.08 
 
 
472 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  38.09 
 
 
470 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  36.91 
 
 
472 aa  269  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  37.41 
 
 
476 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  36.2 
 
 
445 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  35.59 
 
 
478 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  33.64 
 
 
445 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  35.14 
 
 
476 aa  221  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  33.85 
 
 
459 aa  219  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  32.86 
 
 
491 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  33.68 
 
 
487 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  33.94 
 
 
462 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  34.44 
 
 
436 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  32.2 
 
 
482 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  30.6 
 
 
482 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  30.82 
 
 
490 aa  203  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  31.28 
 
 
488 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  29.07 
 
 
493 aa  196  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  33.08 
 
 
542 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  30.58 
 
 
477 aa  183  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  30.48 
 
 
482 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  31.57 
 
 
473 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  28.57 
 
 
490 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  28.15 
 
 
473 aa  154  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  31.33 
 
 
442 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  30.68 
 
 
445 aa  151  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  29.71 
 
 
798 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  30.11 
 
 
432 aa  143  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  30.85 
 
 
438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  28.02 
 
 
471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  29.94 
 
 
479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  26.56 
 
 
485 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  31.14 
 
 
469 aa  138  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  29.31 
 
 
480 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  28.68 
 
 
492 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  29.01 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  27.37 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  27.84 
 
 
470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  29.78 
 
 
479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  29.78 
 
 
479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  30.06 
 
 
479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  31.71 
 
 
479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  28.45 
 
 
481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  29.96 
 
 
480 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  29.19 
 
 
488 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  29.53 
 
 
482 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  26.04 
 
 
467 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  27.55 
 
 
474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  27.31 
 
 
462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  26.39 
 
 
464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  28.83 
 
 
512 aa  119  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  26.64 
 
 
435 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  26.56 
 
 
488 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  30.3 
 
 
447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  27.48 
 
 
482 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  28.38 
 
 
465 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  26.96 
 
 
436 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  27.57 
 
 
488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  28.03 
 
 
431 aa  110  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  26.56 
 
 
465 aa  110  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  29.65 
 
 
421 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  28.6 
 
 
437 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  29.09 
 
 
431 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  29.24 
 
 
435 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  27.69 
 
 
423 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  28.41 
 
 
427 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  25.31 
 
 
449 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  23.82 
 
 
461 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  25.75 
 
 
484 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  37.82 
 
 
200 aa  99.8  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  39.1 
 
 
222 aa  94  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  27.78 
 
 
479 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  27.25 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  22.69 
 
 
452 aa  76.6  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2605  protein of unknown function DUF1214  32.94 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461285  hitchhiker  0.000899244 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  23.66 
 
 
456 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  23.4 
 
 
480 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  23.4 
 
 
480 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  34.06 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  33.81 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1116  protein of unknown function DUF1254  29.24 
 
 
191 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  24.47 
 
 
506 aa  65.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  30.86 
 
 
445 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>