122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4372 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  975    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  975    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  53.72 
 
 		 466 aa  490  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5641  hypothetical protein  52.26 
 
 		 465 aa  438  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.617076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  34.87 
 
 		 512 aa  249  8e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3037  hypothetical protein  34.76 
 
 		 496 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  32.7 
 
 		 512 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2579  hypothetical protein  31.98 
 
 		 512 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0604  hypothetical protein  32.09 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  31.68 
 
 		 506 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0264  hypothetical protein  31.3 
 
 		 538 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.11203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04201  hypothetical protein  31.2 
 
 		 507 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02425  hypothetical protein  30.52 
 
 		 518 aa  192  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3030  hypothetical protein  30.57 
 
 		 495 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756301 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  29.82 
 
 		 491 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0592  hypothetical protein  28.51 
 
 		 511 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.930976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3839  protein of unknown function DUF1254  29.27 
 
 		 476 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190359  normal  0.11168 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04191  hypothetical protein  29.16 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0910  hypothetical protein  29.91 
 
 		 517 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.190364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0593  hypothetical protein  29.45 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  26.58 
 
 		 499 aa  143  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3284  hypothetical protein  28.93 
 
 		 493 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  26.84 
 
 		 473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  24.18 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  25.74 
 
 		 482 aa  100  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  23.98 
 
 		 464 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  26.24 
 
 		 472 aa  93.2  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  26.69 
 
 		 462 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  24.94 
 
 		 470 aa  93.2  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  25.7 
 
 		 465 aa  93.2  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  24.58 
 
 		 482 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  23.74 
 
 		 459 aa  92.8  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  26.41 
 
 		 488 aa  92  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  29.01 
 
 		 438 aa  91.3  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  23.09 
 
 		 435 aa  89.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  25.05 
 
 		 471 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  25.51 
 
 		 470 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  27.52 
 
 		 482 aa  87  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  26.86 
 
 		 479 aa  86.7  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  22.12 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  27.4 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  24.44 
 
 		 480 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  22.59 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  21.06 
 
 		 488 aa  84  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  22.17 
 
 		 490 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  25.54 
 
 		 479 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  22.22 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  24.82 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  24.08 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  23.93 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  25.1 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  24.05 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  21.76 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  22.2 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  25.69 
 
 		 512 aa  77.8  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  23.38 
 
 		 473 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  24.94 
 
 		 491 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  23.14 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  23.83 
 
 		 487 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  25.37 
 
 		 480 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  23.53 
 
 		 432 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  24.09 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  23.38 
 
 		 473 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  24.79 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  22.44 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  24.09 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  24.09 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  21.96 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  23.13 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  23.13 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  23.13 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  23.13 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  24.14 
 
 		 542 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  23.11 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  26.32 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  23.72 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  27.98 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  23.52 
 
 		 488 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  27.57 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  27.57 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  27.57 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  24.23 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  31.67 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  27.57 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  21.8 
 
 		 490 aa  67.4  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  22 
 
 		 465 aa  67  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  22.86 
 
 		 475 aa  67  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  24.05 
 
 		 481 aa  66.6  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  22.48 
 
 		 485 aa  67  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  32.77 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  22.7 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  23.38 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  30.89 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  20.64 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  31.67 
 
 		 222 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  23.62 
 
 		 798 aa  63.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  22.47 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  34.21 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  29.93 
 
 		 484 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  25.18 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>