123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5319 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  929    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  56.96 
 
 
479 aa  462  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  40.72 
 
 
447 aa  286  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  27.64 
 
 
445 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  28.42 
 
 
482 aa  160  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  28.25 
 
 
482 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  27.31 
 
 
473 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  28.83 
 
 
478 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  28.6 
 
 
459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  28.75 
 
 
490 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  28.07 
 
 
472 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  27.53 
 
 
476 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  28.06 
 
 
480 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  30 
 
 
442 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  29.11 
 
 
480 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  27.05 
 
 
445 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  27.16 
 
 
470 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  28.03 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  27.72 
 
 
476 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  28.39 
 
 
436 aa  134  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  30.53 
 
 
482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  26.68 
 
 
479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  26.68 
 
 
479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  27.04 
 
 
479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  27.7 
 
 
480 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  25.25 
 
 
488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  29.37 
 
 
437 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  32.94 
 
 
445 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  28.02 
 
 
462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  30.33 
 
 
438 aa  127  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  22.96 
 
 
467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  28.87 
 
 
432 aa  118  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  25.5 
 
 
482 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  25.25 
 
 
461 aa  117  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  29.82 
 
 
465 aa  116  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  28.7 
 
 
473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  25.26 
 
 
798 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  26.21 
 
 
480 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  25.88 
 
 
481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  24.2 
 
 
493 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  24.69 
 
 
477 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  24.9 
 
 
465 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  26.86 
 
 
479 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  29.14 
 
 
423 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  24.43 
 
 
462 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  25.26 
 
 
471 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  27.1 
 
 
488 aa  103  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  25 
 
 
470 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  26.68 
 
 
427 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  28.28 
 
 
469 aa  98.2  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  25.1 
 
 
432 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  24.59 
 
 
512 aa  95.5  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  31.46 
 
 
464 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  24.85 
 
 
473 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  24.95 
 
 
473 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  21.33 
 
 
490 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  38.46 
 
 
200 aa  92.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  24.9 
 
 
470 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  24.38 
 
 
435 aa  91.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  24.68 
 
 
488 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  25.94 
 
 
487 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  24.47 
 
 
492 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  27.05 
 
 
491 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  38.46 
 
 
222 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  36.67 
 
 
436 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  25.62 
 
 
485 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  34.34 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  24.22 
 
 
484 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  22.77 
 
 
474 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  34.69 
 
 
484 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  20.82 
 
 
488 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  25.35 
 
 
479 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  34.62 
 
 
456 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  23.53 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  23.53 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  23.53 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  23.53 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  34.69 
 
 
478 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  34.69 
 
 
478 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  23.32 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  34.69 
 
 
478 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  32.56 
 
 
479 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  35.37 
 
 
475 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  34.01 
 
 
478 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  31.88 
 
 
472 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  21.2 
 
 
431 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  30.43 
 
 
465 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  34.65 
 
 
482 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2605  protein of unknown function DUF1214  33.33 
 
 
291 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461285  hitchhiker  0.000899244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  21.67 
 
 
431 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  21.59 
 
 
435 aa  64.3  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  22.1 
 
 
499 aa  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  30.15 
 
 
445 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  28.95 
 
 
542 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  23.01 
 
 
466 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  30.71 
 
 
449 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3284  hypothetical protein  21.66 
 
 
493 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133196  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  28.08 
 
 
451 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  29.69 
 
 
506 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  23.42 
 
 
480 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>