134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1208 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  984    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  64.72 
 
 		 462 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  54.49 
 
 		 490 aa  558  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  56 
 
 		 474 aa  549  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  52.99 
 
 		 492 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  49.59 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  51.66 
 
 		 512 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  32.37 
 
 		 482 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  29.4 
 
 		 482 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  29.74 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  26.68 
 
 		 445 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  30.74 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  30.79 
 
 		 470 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  29.2 
 
 		 482 aa  181  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  31.33 
 
 		 798 aa  175  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  27.79 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  30.66 
 
 		 476 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  29.5 
 
 		 480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  27.56 
 
 		 467 aa  173  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  31.99 
 
 		 479 aa  172  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  27.49 
 
 		 488 aa  170  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  28.26 
 
 		 476 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  29.82 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  30.75 
 
 		 480 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  28.97 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  29.98 
 
 		 479 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  29.66 
 
 		 480 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  31.58 
 
 		 470 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  29.84 
 
 		 462 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  28.83 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  26.9 
 
 		 445 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  27.46 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  31.71 
 
 		 442 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  30.02 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  30.02 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  27.43 
 
 		 459 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  30.59 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  29.32 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  28.69 
 
 		 479 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  27.89 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  27.16 
 
 		 471 aa  150  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  28.15 
 
 		 464 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  26.6 
 
 		 473 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  26.81 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  26.34 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  27.93 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  30.38 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  29.73 
 
 		 447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  27.74 
 
 		 465 aa  131  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  29.4 
 
 		 479 aa  126  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  25.94 
 
 		 482 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  26.2 
 
 		 542 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  27.59 
 
 		 452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  26.02 
 
 		 473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  24.4 
 
 		 493 aa  120  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  25.56 
 
 		 437 aa  120  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  27.23 
 
 		 436 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  24.14 
 
 		 488 aa  117  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  25.37 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  29.44 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  25.44 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  28.28 
 
 		 470 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  24.84 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  24.84 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  38.61 
 
 		 200 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  29.1 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  25.17 
 
 		 432 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  29.91 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  24.62 
 
 		 473 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  24.62 
 
 		 473 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  24.62 
 
 		 473 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  24.62 
 
 		 473 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  28.08 
 
 		 475 aa  107  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  30.38 
 
 		 451 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  26.55 
 
 		 456 aa  107  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  27.47 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  28.34 
 
 		 472 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  25.91 
 
 		 478 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  26.03 
 
 		 445 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  25.22 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  25.7 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  27.7 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  25.7 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  26.22 
 
 		 487 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  38.36 
 
 		 222 aa  99.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  25.88 
 
 		 491 aa  97.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  25.76 
 
 		 478 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  25.34 
 
 		 512 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  25.32 
 
 		 485 aa  90.9  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0592  hypothetical protein  25.46 
 
 		 511 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.930976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  28.65 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6394  hypothetical protein  22.58 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2605  protein of unknown function DUF1214  29.22 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461285  hitchhiker  0.000899244 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  25.05 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  32.7 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  24.18 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02425  hypothetical protein  24.71 
 
 		 518 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  22.72 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  21.46 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>