123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6080 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  860    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  44.36 
 
 		 432 aa  302  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  39.21 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  35.51 
 
 		 442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  34.55 
 
 		 472 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  31.38 
 
 		 482 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  32.55 
 
 		 436 aa  186  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  34.9 
 
 		 465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  31.7 
 
 		 482 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  35.48 
 
 		 437 aa  183  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  30.33 
 
 		 445 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  36.3 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  36.56 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  34.33 
 
 		 482 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  31.79 
 
 		 438 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  31.59 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  34.07 
 
 		 447 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  30.24 
 
 		 445 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  31.28 
 
 		 477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  29.59 
 
 		 493 aa  162  9e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  30.95 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  30.54 
 
 		 462 aa  161  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  30.64 
 
 		 459 aa  159  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  29.43 
 
 		 476 aa  159  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  30.21 
 
 		 476 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  31.06 
 
 		 478 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  27.08 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  32.74 
 
 		 421 aa  153  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  30.89 
 
 		 473 aa  146  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  31.95 
 
 		 473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  29.07 
 
 		 480 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  29.3 
 
 		 479 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  29.3 
 
 		 479 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  28.34 
 
 		 488 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  29.3 
 
 		 479 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  29.07 
 
 		 479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  29.38 
 
 		 480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  30 
 
 		 480 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  27.29 
 
 		 471 aa  140  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  27.51 
 
 		 479 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  28.64 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  28.74 
 
 		 482 aa  136  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  27.86 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  28.67 
 
 		 490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  27.76 
 
 		 798 aa  133  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  28.84 
 
 		 470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  30.48 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  27.73 
 
 		 488 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  25.71 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  25.82 
 
 		 461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  30.29 
 
 		 488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  29.68 
 
 		 484 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  28.08 
 
 		 492 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  29.05 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  27.59 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  28.21 
 
 		 432 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 473 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 473 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  25.51 
 
 		 490 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  26.61 
 
 		 487 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  26.44 
 
 		 465 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  28.48 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  28.38 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  27.29 
 
 		 491 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  27.69 
 
 		 478 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  27.69 
 
 		 478 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  28.44 
 
 		 470 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  27.98 
 
 		 473 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  27.98 
 
 		 473 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  27.98 
 
 		 473 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  27.98 
 
 		 473 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  27.52 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  27.4 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  24.65 
 
 		 431 aa  100  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  27 
 
 		 479 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  27.02 
 
 		 475 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  26.77 
 
 		 474 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  27 
 
 		 479 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  27.81 
 
 		 512 aa  96.3  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  28.15 
 
 		 478 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  26.96 
 
 		 472 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  26.94 
 
 		 465 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  24.65 
 
 		 431 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  26.61 
 
 		 488 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  26.27 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  39.47 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  23.63 
 
 		 452 aa  80.1  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  36.42 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  25.34 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  26.8 
 
 		 542 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3376  putative lipoprotein  23.43 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00752899  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  25.75 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  24.34 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0604  hypothetical protein  22.42 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6394  hypothetical protein  24.09 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  25.34 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  26.43 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  31.94 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  22.3 
 
 		 506 aa  56.6  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  31.3 
 
 		 466 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>