138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0423 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  968    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  57.68 
 
 		 482 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  57.05 
 
 		 482 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  45.48 
 
 		 445 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  47.29 
 
 		 482 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  46.36 
 
 		 445 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  42.68 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  44.52 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  43.58 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  44.47 
 
 		 478 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  45.37 
 
 		 476 aa  362  8e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  43.52 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  41.32 
 
 		 472 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  41.46 
 
 		 490 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  42.05 
 
 		 436 aa  339  7e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  39.5 
 
 		 462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  42.25 
 
 		 473 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  34.01 
 
 		 473 aa  256  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  35.36 
 
 		 491 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  34.84 
 
 		 487 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  36.23 
 
 		 480 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  33.12 
 
 		 493 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  36.26 
 
 		 480 aa  238  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  35.87 
 
 		 492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  36.87 
 
 		 479 aa  233  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  35.48 
 
 		 512 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  35.31 
 
 		 481 aa  229  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  34.5 
 
 		 470 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  35.65 
 
 		 436 aa  223  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  33.86 
 
 		 798 aa  223  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  31.91 
 
 		 542 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  34.38 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  34.38 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  34.38 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  33.41 
 
 		 488 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  35.04 
 
 		 471 aa  216  7e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  32.39 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  33.55 
 
 		 480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  30.96 
 
 		 474 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  33.49 
 
 		 467 aa  213  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  34.39 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  33.12 
 
 		 480 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  34.08 
 
 		 445 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  30.77 
 
 		 490 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  33.41 
 
 		 442 aa  206  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  29.57 
 
 		 484 aa  203  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  31.7 
 
 		 472 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  30.75 
 
 		 465 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  32.25 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  33.26 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  34.31 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  33.96 
 
 		 432 aa  190  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  32.18 
 
 		 465 aa  186  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  30.86 
 
 		 470 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  35.68 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  32.41 
 
 		 447 aa  182  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  32.13 
 
 		 435 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  30.86 
 
 		 465 aa  179  9e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  30.18 
 
 		 479 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  29.91 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  29.91 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  29.95 
 
 		 479 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  32.06 
 
 		 464 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  28.34 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  29.91 
 
 		 478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  29.75 
 
 		 485 aa  173  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  28.7 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  29.55 
 
 		 432 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  29.55 
 
 		 473 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  29.78 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  31.84 
 
 		 475 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  29.73 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  29.56 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  29.56 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  29.56 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  29.56 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  29.02 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  28.75 
 
 		 482 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  29.73 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  28.64 
 
 		 488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  31.52 
 
 		 423 aa  154  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  43.48 
 
 		 200 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  27.21 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  28.89 
 
 		 452 aa  127  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  26.93 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  28.57 
 
 		 431 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  44.44 
 
 		 222 aa  119  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  27.93 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  27.21 
 
 		 431 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  26.87 
 
 		 451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  27.66 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  26.29 
 
 		 449 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  23.87 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  25.84 
 
 		 445 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  28.38 
 
 		 459 aa  95.1  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  25.7 
 
 		 491 aa  94.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1114  protein of unknown function DUF1254  41.88 
 
 		 196 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6394  hypothetical protein  25.58 
 
 		 491 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  26.34 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1116  protein of unknown function DUF1254  33.53 
 
 		 191 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>