146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0466 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  67.25 
 
 		 459 aa  638    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  100 
 
 		 478 aa  968    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  63.77 
 
 		 490 aa  637    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  63.35 
 
 		 488 aa  628  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  62.9 
 
 		 476 aa  619  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  57.08 
 
 		 445 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  51.03 
 
 		 476 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  53.45 
 
 		 473 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  50 
 
 		 436 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  49.1 
 
 		 445 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  48.85 
 
 		 482 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  45.96 
 
 		 482 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  44.84 
 
 		 470 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  44.21 
 
 		 472 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  44.47 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  45.81 
 
 		 482 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  43.82 
 
 		 462 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  36.49 
 
 		 473 aa  277  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  36.09 
 
 		 487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  34.76 
 
 		 491 aa  250  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  34.65 
 
 		 542 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  35.5 
 
 		 480 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  37.53 
 
 		 479 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  37.66 
 
 		 442 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  37.61 
 
 		 445 aa  240  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  37.66 
 
 		 798 aa  239  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  34.58 
 
 		 471 aa  239  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  38.03 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  38.03 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  35.46 
 
 		 480 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  37.17 
 
 		 480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  34.9 
 
 		 478 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  34.9 
 
 		 478 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  35.81 
 
 		 479 aa  230  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  35.92 
 
 		 488 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  33.41 
 
 		 493 aa  226  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  34 
 
 		 478 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  34.45 
 
 		 478 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  34.23 
 
 		 479 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  34.23 
 
 		 479 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  35.45 
 
 		 481 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  34.23 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  34.01 
 
 		 473 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  34.23 
 
 		 473 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  36.54 
 
 		 480 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  35.76 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  35.44 
 
 		 438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  34.01 
 
 		 473 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  34.01 
 
 		 473 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  34.01 
 
 		 473 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  34.01 
 
 		 473 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  32.85 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  34.33 
 
 		 470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  35.23 
 
 		 475 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  32.85 
 
 		 469 aa  213  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  33.19 
 
 		 485 aa  213  9e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  32.31 
 
 		 472 aa  210  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  31.65 
 
 		 465 aa  209  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  33.78 
 
 		 484 aa  209  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  32.21 
 
 		 461 aa  209  9e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  29.11 
 
 		 467 aa  206  9e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  30.47 
 
 		 436 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  34.27 
 
 		 447 aa  199  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  31.4 
 
 		 437 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  30.7 
 
 		 435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  31.95 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  30.65 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  32.15 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  31.17 
 
 		 482 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  33.18 
 
 		 432 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  32.92 
 
 		 421 aa  173  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  32.07 
 
 		 427 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  29.1 
 
 		 484 aa  167  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  29.39 
 
 		 474 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  28.76 
 
 		 492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  30.23 
 
 		 512 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  26.8 
 
 		 490 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  26.35 
 
 		 462 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  30.63 
 
 		 488 aa  151  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  30.18 
 
 		 488 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  31.53 
 
 		 423 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  43.85 
 
 		 200 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  29.23 
 
 		 479 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  28.37 
 
 		 467 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  27.34 
 
 		 482 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  28.75 
 
 		 451 aa  126  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  39.7 
 
 		 222 aa  123  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  27.47 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  23.83 
 
 		 452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  26.6 
 
 		 431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  28.21 
 
 		 456 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  29.23 
 
 		 449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  26.02 
 
 		 435 aa  117  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6394  hypothetical protein  26.73 
 
 		 491 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1114  protein of unknown function DUF1254  41.18 
 
 		 196 aa  95.9  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  35 
 
 		 445 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  25.3 
 
 		 459 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  23.77 
 
 		 466 aa  87.4  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1116  protein of unknown function DUF1254  29.89 
 
 		 191 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  26.4 
 
 		 512 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>