112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5465 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  919    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  52.14 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  49.45 
 
 		 456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  39.81 
 
 		 452 aa  329  6e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  40.53 
 
 		 445 aa  316  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  28.91 
 
 		 459 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  25.94 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  30 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  26.71 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  28.5 
 
 		 445 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  28.98 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  26.92 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  28.69 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  26.74 
 
 		 470 aa  123  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  25.51 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  28.7 
 
 		 436 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  29.56 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  29.27 
 
 		 462 aa  117  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  28.68 
 
 		 476 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  28.44 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  26.47 
 
 		 467 aa  113  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  26.87 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  27.11 
 
 		 471 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  26.63 
 
 		 488 aa  106  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  28.12 
 
 		 488 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  30.38 
 
 		 484 aa  104  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  30.62 
 
 		 479 aa  103  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  27.63 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  28 
 
 		 480 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  28.53 
 
 		 492 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  26.34 
 
 		 482 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  27.37 
 
 		 465 aa  95.5  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  24.12 
 
 		 482 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  28.02 
 
 		 473 aa  94  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  27.6 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  25.53 
 
 		 481 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  26.61 
 
 		 473 aa  90.5  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  27.31 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  23.21 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  27.39 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  27.37 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  27.59 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  24.64 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  24.05 
 
 		 474 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  26.28 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  26.45 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  26.98 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  28.91 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  27.5 
 
 		 484 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  27.73 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  27.27 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  25 
 
 		 512 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  25.79 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  26.65 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  24.64 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  23.85 
 
 		 485 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  24.35 
 
 		 480 aa  73.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  25.63 
 
 		 480 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  33.55 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  27.52 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  25.5 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  24.69 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  25.9 
 
 		 469 aa  69.7  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  23.66 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  33.73 
 
 		 200 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  23.85 
 
 		 479 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  23.85 
 
 		 479 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2605  protein of unknown function DUF1214  28.08 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461285  hitchhiker  0.000899244 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  23.54 
 
 		 798 aa  66.6  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  36.02 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  36.02 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  36.02 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  36.02 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  36.02 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  36.02 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  25.44 
 
 		 488 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  36.02 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  24.81 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  23.6 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  31.29 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  36.84 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  24.94 
 
 		 542 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  33.04 
 
 		 499 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  23.08 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  30.43 
 
 		 478 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  30.43 
 
 		 478 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0604  hypothetical protein  35.71 
 
 		 457 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  30.43 
 
 		 478 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  34.41 
 
 		 479 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5641  hypothetical protein  34.83 
 
 		 465 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.617076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  27.97 
 
 		 467 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  35.05 
 
 		 506 aa  53.5  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3037  hypothetical protein  33.33 
 
 		 496 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  30.43 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  31.63 
 
 		 491 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  27.42 
 
 		 480 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  27.42 
 
 		 480 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  31.96 
 
 		 512 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  26.5 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04201  hypothetical protein  30.58 
 
 		 507 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>