136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3490 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  100 
 
 
452 aa  912    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  41.74 
 
 
445 aa  351  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  39.81 
 
 
451 aa  329  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  38.28 
 
 
449 aa  320  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  37.94 
 
 
456 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  27.17 
 
 
482 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  29.47 
 
 
490 aa  136  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  28.47 
 
 
476 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  28.61 
 
 
445 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  25.71 
 
 
472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  27.45 
 
 
445 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  28.1 
 
 
488 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  27.19 
 
 
470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  28.89 
 
 
477 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  29.1 
 
 
490 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  25.97 
 
 
482 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  29.22 
 
 
474 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  28.61 
 
 
473 aa  123  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  29.57 
 
 
471 aa  122  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  25.99 
 
 
436 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  27.34 
 
 
484 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  28.24 
 
 
459 aa  120  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  27.91 
 
 
488 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  23.24 
 
 
478 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  25.94 
 
 
482 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  27.44 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  27.7 
 
 
437 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  28.04 
 
 
436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  25.45 
 
 
462 aa  110  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  28.57 
 
 
492 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  25 
 
 
469 aa  106  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  27.51 
 
 
465 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  27.23 
 
 
467 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  25.96 
 
 
442 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  26.58 
 
 
461 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  25.27 
 
 
432 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  25.27 
 
 
473 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  25.27 
 
 
473 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  25.27 
 
 
473 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  25.27 
 
 
473 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  25.27 
 
 
473 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  25.27 
 
 
473 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  23.81 
 
 
470 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  24.89 
 
 
479 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  27.05 
 
 
447 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  25.12 
 
 
481 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  25.44 
 
 
465 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  25.2 
 
 
438 aa  100  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  22.57 
 
 
493 aa  99.8  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  27.05 
 
 
462 aa  99.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  24.4 
 
 
484 aa  97.8  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  27.93 
 
 
432 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  25.22 
 
 
488 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  26.14 
 
 
488 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  23.38 
 
 
482 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  25.85 
 
 
798 aa  95.5  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  26.85 
 
 
479 aa  94.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  25.37 
 
 
473 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  24.49 
 
 
472 aa  94  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  26.6 
 
 
512 aa  93.6  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  24.38 
 
 
421 aa  93.6  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  25.67 
 
 
480 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  23.47 
 
 
485 aa  92.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  26.28 
 
 
480 aa  89.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  24.28 
 
 
479 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  24.58 
 
 
479 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  24.58 
 
 
479 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  23.72 
 
 
445 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  25.53 
 
 
464 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  35.29 
 
 
480 aa  87  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  27.79 
 
 
435 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  24.66 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  23.38 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  26.21 
 
 
470 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  35.1 
 
 
480 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  33.33 
 
 
200 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  23.41 
 
 
487 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  22.22 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  24.04 
 
 
491 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  32.21 
 
 
466 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  21.94 
 
 
479 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  32.87 
 
 
512 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  22.59 
 
 
479 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  21.78 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  21.78 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  31.85 
 
 
478 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  23.63 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  29.27 
 
 
222 aa  71.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  22.49 
 
 
475 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  23.09 
 
 
467 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  23.96 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0592  hypothetical protein  34.21 
 
 
511 aa  67.8  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.930976  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  32.39 
 
 
482 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  33.56 
 
 
459 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  28.26 
 
 
506 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  38.04 
 
 
491 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3030  hypothetical protein  29.85 
 
 
495 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.756301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  29.29 
 
 
499 aa  63.5  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6394  hypothetical protein  29.33 
 
 
491 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2605  protein of unknown function DUF1214  31.52 
 
 
291 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461285  hitchhiker  0.000899244 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>