92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1116 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1116  protein of unknown function DUF1254  100 
 
 		 191 aa  382  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1114  protein of unknown function DUF1254  51.91 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  43.24 
 
 		 438 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  38.85 
 
 		 472 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  39.58 
 
 		 442 aa  95.9  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  34.91 
 
 		 447 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  30.81 
 
 		 476 aa  91.3  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  35.29 
 
 		 470 aa  91.3  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  35.56 
 
 		 473 aa  90.1  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  30.41 
 
 		 459 aa  89.4  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  32.76 
 
 		 445 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  29.89 
 
 		 478 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  33.53 
 
 		 477 aa  84.7  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  36.81 
 
 		 488 aa  84  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  30.99 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  28.8 
 
 		 490 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  36.28 
 
 		 467 aa  82.8  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 488 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  34.31 
 
 		 798 aa  79  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  32.73 
 
 		 436 aa  78.6  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  35.97 
 
 		 481 aa  77.8  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  38.79 
 
 		 479 aa  77.8  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  31.4 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  28.32 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  36.7 
 
 		 491 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  32.62 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  29.07 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  33.33 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  36.28 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  27.53 
 
 		 482 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  34.86 
 
 		 487 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  37.93 
 
 		 445 aa  72.4  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  34.53 
 
 		 480 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  31.43 
 
 		 435 aa  71.2  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  36.84 
 
 		 479 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  31.89 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  35.65 
 
 		 470 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  30.63 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  35.96 
 
 		 479 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  35.96 
 
 		 479 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  35.96 
 
 		 479 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  37.04 
 
 		 482 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  28.98 
 
 		 476 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  37.5 
 
 		 542 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  28.24 
 
 		 472 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  31.62 
 
 		 474 aa  68.2  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  31.11 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  29.65 
 
 		 475 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  32.4 
 
 		 471 aa  66.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  36.21 
 
 		 432 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  28.57 
 
 		 480 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  29.82 
 
 		 484 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  28.98 
 
 		 464 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  28.07 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  28.07 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  28.07 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  28.07 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  28.07 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  28.07 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  35.9 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  30.66 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  28.07 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  30.83 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  31.25 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  25.88 
 
 		 470 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  29.82 
 
 		 478 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  29.82 
 
 		 478 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  29.24 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  29.82 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  30.41 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  29.82 
 
 		 479 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  29.2 
 
 		 492 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  33.94 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  28.21 
 
 		 490 aa  56.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  31.82 
 
 		 437 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  30.63 
 
 		 479 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  30.97 
 
 		 484 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  40.28 
 
 		 467 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  30.83 
 
 		 436 aa  51.6  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  28.87 
 
 		 461 aa  51.6  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  24.16 
 
 		 435 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  31.3 
 
 		 512 aa  48.5  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3037  hypothetical protein  31.3 
 
 		 496 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  25.53 
 
 		 465 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0264  hypothetical protein  33.04 
 
 		 538 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.11203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  30.17 
 
 		 423 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  28.28 
 
 		 488 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  29.93 
 
 		 465 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  25.51 
 
 		 445 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3376  putative lipoprotein  30.84 
 
 		 406 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00752899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  23.89 
 
 		 482 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>