72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0264 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0264  hypothetical protein  100 
 
 		 538 aa  1101    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.11203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  41.7 
 
 		 512 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2579  hypothetical protein  41.44 
 
 		 512 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02425  hypothetical protein  40.52 
 
 		 518 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0604  hypothetical protein  42.05 
 
 		 457 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04191  hypothetical protein  39.66 
 
 		 515 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04201  hypothetical protein  38.26 
 
 		 507 aa  330  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0910  hypothetical protein  38.19 
 
 		 517 aa  318  2e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.190364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  32.88 
 
 		 512 aa  266  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3284  hypothetical protein  35.76 
 
 		 493 aa  246  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133196  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0592  hypothetical protein  31.88 
 
 		 511 aa  239  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.930976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  30.06 
 
 		 506 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3839  protein of unknown function DUF1254  31.86 
 
 		 476 aa  223  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190359  normal  0.11168 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  30.02 
 
 		 491 aa  220  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3030  hypothetical protein  30.82 
 
 		 495 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  31.13 
 
 		 466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  30.41 
 
 		 480 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  30.41 
 
 		 480 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0593  hypothetical protein  28.14 
 
 		 499 aa  182  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5641  hypothetical protein  29 
 
 		 465 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.617076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3037  hypothetical protein  26.65 
 
 		 496 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533722  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  25.83 
 
 		 499 aa  146  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  22.74 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  23.87 
 
 		 445 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  24.07 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  22.32 
 
 		 482 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  22.35 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  22.25 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  23.86 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  25.23 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  25.23 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  25.23 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  23.08 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  24.78 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  20.97 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  21.56 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  22.39 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  26.42 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  23.56 
 
 		 480 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  21.35 
 
 		 465 aa  55.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  22.27 
 
 		 492 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  23.33 
 
 		 485 aa  53.5  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  31.71 
 
 		 488 aa  53.5  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  26.02 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  24.19 
 
 		 479 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  21.41 
 
 		 459 aa  51.2  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  22.56 
 
 		 480 aa  50.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  21.87 
 
 		 490 aa  50.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  31.75 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  28.91 
 
 		 445 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  29.69 
 
 		 484 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  29.41 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  23.78 
 
 		 798 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  21.96 
 
 		 476 aa  48.9  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  25.95 
 
 		 427 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  22.79 
 
 		 482 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  20.67 
 
 		 474 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  25.2 
 
 		 488 aa  48.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  30.63 
 
 		 445 aa  48.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  22.52 
 
 		 470 aa  47.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  27.78 
 
 		 456 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  30.16 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  20.81 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  26.96 
 
 		 467 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1116  protein of unknown function DUF1254  33.04 
 
 		 191 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  23.99 
 
 		 480 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  22.73 
 
 		 470 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  21.65 
 
 		 487 aa  44.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  32.5 
 
 		 482 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  25.76 
 
 		 452 aa  43.5  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1083  protein of unknown function DUF1214  30 
 
 		 347 aa  43.5  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1345  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  24.38 
 
 		 478 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>