89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0910 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0910  hypothetical protein  100 
 
 
517 aa  1056    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.190364  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04191  hypothetical protein  79.52 
 
 
515 aa  808    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2579  hypothetical protein  52.82 
 
 
512 aa  535  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04201  hypothetical protein  53.41 
 
 
507 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02425  hypothetical protein  50.2 
 
 
518 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0264  hypothetical protein  38.19 
 
 
538 aa  343  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.11203  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  38.95 
 
 
512 aa  342  1e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0604  hypothetical protein  39.96 
 
 
457 aa  317  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3284  hypothetical protein  36.44 
 
 
493 aa  262  8.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3030  hypothetical protein  31.57 
 
 
495 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.756301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3839  protein of unknown function DUF1254  31.55 
 
 
476 aa  219  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190359  normal  0.11168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0592  hypothetical protein  31.73 
 
 
511 aa  219  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.930976  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  31.59 
 
 
506 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  31.02 
 
 
491 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  32.74 
 
 
466 aa  209  8e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  30.37 
 
 
512 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  31.73 
 
 
499 aa  199  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0593  hypothetical protein  28.93 
 
 
499 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319559  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  29.91 
 
 
480 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  29.91 
 
 
480 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5641  hypothetical protein  33.96 
 
 
465 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.617076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3037  hypothetical protein  28.45 
 
 
496 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533722  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  28.61 
 
 
473 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  24.94 
 
 
465 aa  89.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  23.93 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  24.33 
 
 
461 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  25.24 
 
 
472 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  25.06 
 
 
480 aa  76.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  25.23 
 
 
432 aa  74.3  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  23.74 
 
 
482 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  24.84 
 
 
465 aa  73.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  25 
 
 
459 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  21.62 
 
 
445 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  25.19 
 
 
476 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  24.63 
 
 
488 aa  71.6  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  23.57 
 
 
467 aa  70.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  25.39 
 
 
480 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  24.08 
 
 
488 aa  68.6  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  23.99 
 
 
490 aa  65.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  23.94 
 
 
492 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  22.72 
 
 
480 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  24.72 
 
 
481 aa  64.7  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  24.88 
 
 
478 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  24.05 
 
 
477 aa  63.9  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  22.87 
 
 
470 aa  63.9  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  25.18 
 
 
471 aa  63.9  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  27.46 
 
 
485 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  24.88 
 
 
438 aa  63.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  24.07 
 
 
482 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  22.44 
 
 
462 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  22.93 
 
 
476 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  24.5 
 
 
479 aa  61.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  24.43 
 
 
436 aa  60.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  25 
 
 
445 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  23.67 
 
 
490 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  23.26 
 
 
493 aa  57.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  26.6 
 
 
482 aa  57  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  26.19 
 
 
470 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  22.36 
 
 
437 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  30.47 
 
 
512 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  24.08 
 
 
464 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  22.81 
 
 
482 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  23.24 
 
 
798 aa  51.6  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  28.91 
 
 
488 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  31.09 
 
 
447 aa  51.2  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  34.23 
 
 
456 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  28 
 
 
445 aa  50.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  21.87 
 
 
436 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  27.41 
 
 
427 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6394  hypothetical protein  25.95 
 
 
491 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  24.94 
 
 
473 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  23.99 
 
 
423 aa  48.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  21.56 
 
 
469 aa  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  30.83 
 
 
488 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1476  protein of unknown function DUF1214  36.26 
 
 
336 aa  47.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  26.36 
 
 
442 aa  47.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  29.57 
 
 
449 aa  47  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  23.56 
 
 
435 aa  47  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  30.97 
 
 
222 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  22.44 
 
 
470 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2605  protein of unknown function DUF1214  31.78 
 
 
291 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461285  hitchhiker  0.000899244 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  29.17 
 
 
452 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  27.48 
 
 
200 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  26.23 
 
 
479 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  28.46 
 
 
462 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  21.41 
 
 
459 aa  43.9  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  22.57 
 
 
473 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  22.57 
 
 
473 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  23.98 
 
 
479 aa  43.5  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>