78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1083 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1083  protein of unknown function DUF1214  100 
 
 		 347 aa  714    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1476  protein of unknown function DUF1214  76.35 
 
 		 336 aa  553  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5159  hypothetical protein  55.31 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5225  hypothetical protein  51.01 
 
 		 348 aa  355  7.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582161  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  53.05 
 
 		 798 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2722  hypothetical protein  49.69 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198072 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5466  hypothetical protein  47.94 
 
 		 375 aa  325  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1293  protein of unknown function DUF1214  44.21 
 
 		 345 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282416  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0734  protein of unknown function DUF1214  38.14 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3687  hypothetical protein  55.15 
 
 		 166 aa  202  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03471  hypothetical protein  34.21 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1118  hypothetical protein  33.44 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0540786  normal  0.375546 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0555  hypothetical protein  31.21 
 
 		 325 aa  159  7e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311779  normal  0.0765605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3690  hypothetical protein  47.45 
 
 		 151 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0844  putative lipoprotein  29.67 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6674  soluble lytic murein transglycosylase  29.41 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2460  putative lipoprotein  25.48 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2034  hypothetical protein  38.03 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  30.81 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  33.74 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  30.41 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  38.46 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  34.42 
 
 		 482 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  37.5 
 
 		 492 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  40.62 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  34.53 
 
 		 482 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  36.56 
 
 		 465 aa  56.2  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  32.59 
 
 		 478 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  28.72 
 
 		 473 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  31.61 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  32.09 
 
 		 447 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  36.47 
 
 		 470 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  29 
 
 		 488 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  28.65 
 
 		 488 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  35.58 
 
 		 488 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5651  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  30.88 
 
 		 427 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  32.69 
 
 		 482 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  29.38 
 
 		 435 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  30.59 
 
 		 480 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  29.24 
 
 		 435 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  32.29 
 
 		 469 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  30 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  30.16 
 
 		 461 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  34.85 
 
 		 493 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  29.19 
 
 		 436 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  32.14 
 
 		 472 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  29.63 
 
 		 490 aa  46.6  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04201  hypothetical protein  32.8 
 
 		 507 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  29.67 
 
 		 437 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  28.09 
 
 		 189 aa  46.6  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  30.93 
 
 		 466 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  31.06 
 
 		 480 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  32.56 
 
 		 476 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  28.03 
 
 		 465 aa  46.2  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  28.77 
 
 		 191 aa  46.2  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  26.56 
 
 		 467 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  31.82 
 
 		 472 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  30.71 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  29.32 
 
 		 470 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  24.09 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  29.37 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0604  hypothetical protein  33.66 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  30.56 
 
 		 491 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  36.36 
 
 		 512 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  30.46 
 
 		 477 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02425  hypothetical protein  35.29 
 
 		 518 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  30.29 
 
 		 470 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  28.21 
 
 		 479 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  35.42 
 
 		 462 aa  43.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0264  hypothetical protein  30 
 
 		 538 aa  43.5  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.11203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  26.26 
 
 		 445 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  28.83 
 
 		 473 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3037  hypothetical protein  30.61 
 
 		 496 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  34.83 
 
 		 512 aa  43.1  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  29.13 
 
 		 421 aa  43.1  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0910  hypothetical protein  33.33 
 
 		 517 aa  42.7  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.190364  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>