12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2460 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2460  putative lipoprotein  100 
 
 		 341 aa  709    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0844  putative lipoprotein  30.2 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1083  protein of unknown function DUF1214  25.48 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1476  protein of unknown function DUF1214  24.15 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  24.45 
 
 		 798 aa  67.4  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5466  hypothetical protein  22.48 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1293  protein of unknown function DUF1214  24.18 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282416  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2722  hypothetical protein  22.96 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198072 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5159  hypothetical protein  20.97 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5225  hypothetical protein  21.29 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582161  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0734  protein of unknown function DUF1214  23.34 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0555  hypothetical protein  23.39 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311779  normal  0.0765605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>