80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0841 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  57.59 
 
 		 189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0895  hypothetical protein  41.97 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2218  hypothetical protein  38.22 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  31.94 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3055  hypothetical protein  31.65 
 
 		 193 aa  87.8  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1149  hypothetical protein  31.65 
 
 		 192 aa  88.2  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  32.08 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1663  protein of unknown function DUF1214  33.51 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  33.54 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1952  hypothetical protein  31.65 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1410  hypothetical protein  33.89 
 
 		 191 aa  85.5  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3507  hypothetical protein  32.91 
 
 		 192 aa  84.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.315458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2072  protein of unknown function DUF1214  29.75 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1632  hypothetical protein  34.62 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.208054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0877  hypothetical protein  34.08 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.000472414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0863  protein of unknown function DUF1214  35.37 
 
 		 227 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0927  hypothetical protein  34.07 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0888  protein of unknown function DUF1214  34.19 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0719  protein of unknown function DUF1214  33.12 
 
 		 237 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506594  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  33.8 
 
 		 435 aa  67.8  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  35.14 
 
 		 465 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  33.8 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1322  hypothetical protein  31.72 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0882  hypothetical protein  26.04 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314045  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  34.75 
 
 		 436 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1116  hypothetical protein  32.48 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.521677 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2678  hypothetical protein  27.92 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0582  hypothetical protein  28.42 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0921735  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0582  hypothetical protein  28.42 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  30.43 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0625  hypothetical protein  28.48 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  30.92 
 
 		 492 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  28.19 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  33.73 
 
 		 421 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  33.87 
 
 		 476 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  29.38 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  30.3 
 
 		 485 aa  53.9  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  27.74 
 
 		 490 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  28.76 
 
 		 456 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  32.61 
 
 		 437 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  34.68 
 
 		 478 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  31.68 
 
 		 438 aa  51.6  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  30.19 
 
 		 482 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  28.3 
 
 		 465 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  30.99 
 
 		 482 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  31.5 
 
 		 490 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  34.13 
 
 		 482 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  29.93 
 
 		 452 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  30.56 
 
 		 436 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  26.03 
 
 		 445 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  28.08 
 
 		 476 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1476  protein of unknown function DUF1214  30.99 
 
 		 336 aa  48.9  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  29.08 
 
 		 474 aa  48.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  31.71 
 
 		 459 aa  48.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  27.78 
 
 		 484 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  29.13 
 
 		 470 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  30.16 
 
 		 493 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  29.3 
 
 		 482 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  28.23 
 
 		 445 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1083  protein of unknown function DUF1214  25.69 
 
 		 347 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1345  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  28.99 
 
 		 512 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  29.37 
 
 		 445 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  32.37 
 
 		 480 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0893  protein of unknown function DUF1214  24.03 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  30.08 
 
 		 431 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3687  hypothetical protein  28.97 
 
 		 166 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  26.39 
 
 		 462 aa  44.7  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  28.08 
 
 		 449 aa  44.7  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  27.32 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  38.89 
 
 		 473 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3376  putative lipoprotein  28.68 
 
 		 406 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00752899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1021  protein of unknown function DUF1214  24.03 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  32 
 
 		 479 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  26.42 
 
 		 473 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  27.78 
 
 		 451 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  31.25 
 
 		 462 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  26.58 
 
 		 477 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2722  hypothetical protein  27.93 
 
 		 318 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198072 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  28.85 
 
 		 478 aa  41.2  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>