32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0877 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0877  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  434  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.000472414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0927  hypothetical protein  65.16 
 
 
243 aa  280  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0863  protein of unknown function DUF1214  73.06 
 
 
227 aa  275  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0888  protein of unknown function DUF1214  65.61 
 
 
243 aa  267  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0719  protein of unknown function DUF1214  61.5 
 
 
237 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506594  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1116  hypothetical protein  64.14 
 
 
250 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.521677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1663  protein of unknown function DUF1214  44.39 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3055  hypothetical protein  41.79 
 
 
193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1410  hypothetical protein  40.43 
 
 
191 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1952  hypothetical protein  42.62 
 
 
192 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3507  hypothetical protein  41.53 
 
 
192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.315458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  39.34 
 
 
192 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  41.76 
 
 
192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1149  hypothetical protein  41.52 
 
 
192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0893  protein of unknown function DUF1214  42.08 
 
 
195 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547941  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0582  hypothetical protein  41.12 
 
 
203 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0582  hypothetical protein  41.12 
 
 
203 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0921735  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1021  protein of unknown function DUF1214  41.67 
 
 
195 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459072  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2072  protein of unknown function DUF1214  40.8 
 
 
192 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0625  hypothetical protein  40.93 
 
 
195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2678  hypothetical protein  43.55 
 
 
200 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1322  hypothetical protein  35.64 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1632  hypothetical protein  39.88 
 
 
188 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.208054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0882  hypothetical protein  36.52 
 
 
194 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0895  hypothetical protein  35 
 
 
194 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  33.54 
 
 
190 aa  84.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  34.52 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  30.63 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2218  hypothetical protein  28.12 
 
 
194 aa  62  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  26.77 
 
 
488 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  29.61 
 
 
479 aa  42  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  34.59 
 
 
478 aa  41.6  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>