88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1786 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  380  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3055  hypothetical protein  78.65 
 
 		 193 aa  322  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3507  hypothetical protein  80.73 
 
 		 192 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.315458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  81.68 
 
 		 192 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1952  hypothetical protein  78.65 
 
 		 192 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2072  protein of unknown function DUF1214  73.44 
 
 		 192 aa  286  9e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1149  hypothetical protein  79.88 
 
 		 192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1410  hypothetical protein  49.21 
 
 		 191 aa  187  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1663  protein of unknown function DUF1214  42.93 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0863  protein of unknown function DUF1214  42.51 
 
 		 227 aa  130  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0877  hypothetical protein  41.76 
 
 		 227 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.000472414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0927  hypothetical protein  38.1 
 
 		 243 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0888  protein of unknown function DUF1214  41.32 
 
 		 243 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1116  hypothetical protein  41.52 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.521677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0719  protein of unknown function DUF1214  41.52 
 
 		 237 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506594  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1322  hypothetical protein  36.36 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0893  protein of unknown function DUF1214  33.33 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1632  hypothetical protein  42.11 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.208054 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1021  protein of unknown function DUF1214  32.81 
 
 		 195 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0895  hypothetical protein  33.51 
 
 		 194 aa  104  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0582  hypothetical protein  34.57 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0582  hypothetical protein  34.57 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0921735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0625  hypothetical protein  33.85 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2678  hypothetical protein  32.98 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0882  hypothetical protein  32.78 
 
 		 194 aa  97.8  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  33.54 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  31.85 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  28.8 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  31.25 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  35.85 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  32.89 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  30.63 
 
 		 465 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  32.71 
 
 		 499 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  30.67 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  24.22 
 
 		 490 aa  55.1  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  33.02 
 
 		 478 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  35.05 
 
 		 485 aa  54.7  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  27.27 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  29.75 
 
 		 488 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  33.33 
 
 		 462 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  27.61 
 
 		 445 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  32.89 
 
 		 445 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2218  hypothetical protein  23.4 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  36 
 
 		 473 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  29.79 
 
 		 464 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  27.59 
 
 		 476 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  33.86 
 
 		 447 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  26.97 
 
 		 435 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  29.85 
 
 		 469 aa  49.3  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  28.68 
 
 		 476 aa  48.5  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  27.88 
 
 		 461 aa  48.5  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  28.35 
 
 		 488 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  30.19 
 
 		 482 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  31.33 
 
 		 438 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  27.7 
 
 		 512 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  33.72 
 
 		 465 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  25.69 
 
 		 492 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  31.34 
 
 		 488 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  29.41 
 
 		 482 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  26.81 
 
 		 484 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  32.63 
 
 		 480 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  28.3 
 
 		 472 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  32.89 
 
 		 477 aa  45.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  39.24 
 
 		 480 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  31.58 
 
 		 480 aa  44.7  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  25.19 
 
 		 467 aa  44.7  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  29.67 
 
 		 436 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  31.13 
 
 		 491 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  29.08 
 
 		 452 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  33.71 
 
 		 459 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  32.41 
 
 		 472 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  32.31 
 
 		 473 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  25 
 
 		 431 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0604  hypothetical protein  27.78 
 
 		 457 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  34.62 
 
 		 479 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  34.48 
 
 		 456 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  31.48 
 
 		 465 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  26.98 
 
 		 445 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  27.14 
 
 		 493 aa  42  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  32.38 
 
 		 479 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  28.57 
 
 		 479 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3687  hypothetical protein  30.49 
 
 		 166 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  32.5 
 
 		 479 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  28.57 
 
 		 479 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  26.98 
 
 		 474 aa  41.2  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  25.2 
 
 		 462 aa  41.6  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0264  hypothetical protein  28.23 
 
 		 538 aa  41.2  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.11203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04191  hypothetical protein  28.07 
 
 		 515 aa  41.2  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>