29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0882 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0882  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314045  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0582  hypothetical protein  39.47 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0921735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0625  hypothetical protein  40.62 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0582  hypothetical protein  39.47 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0893  protein of unknown function DUF1214  38.02 
 
 		 195 aa  141  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1021  protein of unknown function DUF1214  36.46 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2678  hypothetical protein  37.37 
 
 		 200 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1322  hypothetical protein  37.31 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0719  protein of unknown function DUF1214  40.68 
 
 		 237 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506594  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3507  hypothetical protein  35.94 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.315458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3055  hypothetical protein  34.9 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1116  hypothetical protein  41.07 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.521677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1952  hypothetical protein  34.9 
 
 		 192 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1410  hypothetical protein  33.7 
 
 		 191 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0877  hypothetical protein  36.52 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.000472414 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  32.29 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  32.57 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0863  protein of unknown function DUF1214  35.43 
 
 		 227 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1663  protein of unknown function DUF1214  34.03 
 
 		 192 aa  95.5  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372229 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0927  hypothetical protein  33.67 
 
 		 243 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1149  hypothetical protein  34.78 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2072  protein of unknown function DUF1214  31.64 
 
 		 192 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0888  protein of unknown function DUF1214  34.86 
 
 		 243 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1632  hypothetical protein  34.29 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.208054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0895  hypothetical protein  31.48 
 
 		 194 aa  84.7  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  30.82 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  40.54 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  27.04 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2218  hypothetical protein  23.93 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>