29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0719 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0719  protein of unknown function DUF1214  100 
 
 		 237 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506594  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1116  hypothetical protein  84.81 
 
 		 250 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.521677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0927  hypothetical protein  59.8 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0877  hypothetical protein  65.73 
 
 		 227 aa  224  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.000472414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0888  protein of unknown function DUF1214  60.29 
 
 		 243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0863  protein of unknown function DUF1214  61.22 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1663  protein of unknown function DUF1214  42.05 
 
 		 192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1021  protein of unknown function DUF1214  40.53 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0625  hypothetical protein  42.11 
 
 		 195 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3055  hypothetical protein  41.24 
 
 		 193 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0893  protein of unknown function DUF1214  39.47 
 
 		 195 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  41.24 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0582  hypothetical protein  42.05 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0582  hypothetical protein  42.05 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0921735  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3507  hypothetical protein  42.56 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.315458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1952  hypothetical protein  42.56 
 
 		 192 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1149  hypothetical protein  45.03 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1410  hypothetical protein  43.95 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2072  protein of unknown function DUF1214  40.76 
 
 		 192 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1322  hypothetical protein  35.79 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0882  hypothetical protein  39.78 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314045  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  41.52 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2678  hypothetical protein  40.64 
 
 		 200 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1632  hypothetical protein  41.21 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.208054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0895  hypothetical protein  33.5 
 
 		 194 aa  86.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  34.39 
 
 		 189 aa  72  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  33.12 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2218  hypothetical protein  29.38 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>