45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2218 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2218  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0895  hypothetical protein  40.93 
 
 		 194 aa  131  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  38.89 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  42.11 
 
 		 191 aa  118  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  38.75 
 
 		 189 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2678  hypothetical protein  28.18 
 
 		 200 aa  72  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0893  protein of unknown function DUF1214  27.98 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0582  hypothetical protein  27.04 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0582  hypothetical protein  27.04 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0921735  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1322  hypothetical protein  27.55 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1021  protein of unknown function DUF1214  26.79 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0863  protein of unknown function DUF1214  29.52 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1116  hypothetical protein  29.17 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.521677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0877  hypothetical protein  28.66 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.000472414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0719  protein of unknown function DUF1214  29.76 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506594  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  32.3 
 
 		 464 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0927  hypothetical protein  28.42 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1632  hypothetical protein  31.97 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.208054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3055  hypothetical protein  24.86 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0888  protein of unknown function DUF1214  28.31 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1952  hypothetical protein  25.41 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3507  hypothetical protein  25.41 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.315458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0625  hypothetical protein  27.6 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  32.91 
 
 		 436 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  26.63 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  26.14 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1410  hypothetical protein  25.81 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1663  protein of unknown function DUF1214  25.56 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0882  hypothetical protein  23.93 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314045  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2072  protein of unknown function DUF1214  25 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1149  hypothetical protein  24.66 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  34.48 
 
 		 465 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  30.56 
 
 		 435 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  28.19 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  28.14 
 
 		 476 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  35.16 
 
 		 421 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  27.78 
 
 		 456 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  30.92 
 
 		 469 aa  45.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  29.44 
 
 		 437 aa  45.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  27.33 
 
 		 452 aa  45.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  32 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  28.48 
 
 		 445 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  28.95 
 
 		 482 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  31.25 
 
 		 466 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  28.76 
 
 		 432 aa  41.6  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>