31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1118 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1118  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  765    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0540786  normal  0.375546 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03471  hypothetical protein  54.28 
 
 
354 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0555  hypothetical protein  54.23 
 
 
325 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311779  normal  0.0765605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1083  protein of unknown function DUF1214  33.44 
 
 
347 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1476  protein of unknown function DUF1214  32.92 
 
 
336 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5159  hypothetical protein  34.44 
 
 
344 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  34.69 
 
 
798 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5225  hypothetical protein  33.33 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582161  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2722  hypothetical protein  32.5 
 
 
318 aa  159  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.198072 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5466  hypothetical protein  30.24 
 
 
375 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1293  protein of unknown function DUF1214  29.25 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282416  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0734  protein of unknown function DUF1214  27.95 
 
 
314 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6674  soluble lytic murein transglycosylase  27.08 
 
 
339 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3690  hypothetical protein  34.72 
 
 
151 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91193  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3687  hypothetical protein  36.69 
 
 
166 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796521  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0844  putative lipoprotein  24.82 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  35.04 
 
 
476 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2034  hypothetical protein  35.21 
 
 
92 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  27.06 
 
 
480 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  34.95 
 
 
506 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  30.85 
 
 
491 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  27.88 
 
 
479 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  27.38 
 
 
480 aa  46.6  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  32.26 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  26.97 
 
 
445 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04201  hypothetical protein  35.71 
 
 
507 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  30.2 
 
 
482 aa  43.9  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  30.39 
 
 
466 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  29.41 
 
 
490 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  27.94 
 
 
465 aa  43.1  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  31.82 
 
 
512 aa  42.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>