18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2034 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2034  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  193  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5159  hypothetical protein  48.61 
 
 		 344 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  45.83 
 
 		 798 aa  78.2  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3687  hypothetical protein  42.25 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5466  hypothetical protein  48.61 
 
 		 375 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5225  hypothetical protein  44.44 
 
 		 348 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582161  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1476  protein of unknown function DUF1214  39.44 
 
 		 336 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2722  hypothetical protein  41.33 
 
 		 318 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198072 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1083  protein of unknown function DUF1214  38.03 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1345  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1293  protein of unknown function DUF1214  37.5 
 
 		 345 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282416  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03471  hypothetical protein  36.92 
 
 		 354 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1118  hypothetical protein  35.21 
 
 		 370 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0540786  normal  0.375546 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0555  hypothetical protein  36.62 
 
 		 325 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311779  normal  0.0765605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0734  protein of unknown function DUF1214  35.94 
 
 		 314 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  29.87 
 
 		 445 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  32.47 
 
 		 490 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  28.57 
 
 		 476 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  29.11 
 
 		 469 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>