30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6674 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6674  soluble lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 339 aa  711    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5466  hypothetical protein  31.61 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  31.42 
 
 		 798 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5225  hypothetical protein  30.77 
 
 		 348 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582161  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5159  hypothetical protein  29.39 
 
 		 344 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1083  protein of unknown function DUF1214  29.41 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1476  protein of unknown function DUF1214  28.35 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0734  protein of unknown function DUF1214  29.86 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2722  hypothetical protein  30.91 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1293  protein of unknown function DUF1214  28.26 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282416  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0555  hypothetical protein  29.82 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311779  normal  0.0765605 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1118  hypothetical protein  27.08 
 
 		 370 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0540786  normal  0.375546 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03471  hypothetical protein  27.27 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0844  putative lipoprotein  28.2 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3690  hypothetical protein  36.5 
 
 		 151 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  27.41 
 
 		 445 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  24.74 
 
 		 436 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  28.03 
 
 		 436 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  29.17 
 
 		 490 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3284  hypothetical protein  36.27 
 
 		 493 aa  46.2  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  23.61 
 
 		 431 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  30.84 
 
 		 459 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  30.34 
 
 		 482 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  27.66 
 
 		 462 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3687  hypothetical protein  26.9 
 
 		 166 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  26.11 
 
 		 435 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  29.47 
 
 		 482 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  34.02 
 
 		 471 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  28.87 
 
 		 476 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  31.78 
 
 		 431 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>