11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5651 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5651  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  146  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5159  hypothetical protein  71.05 
 
 		 344 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5225  hypothetical protein  65.79 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582161  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  68.42 
 
 		 798 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2722  hypothetical protein  61.54 
 
 		 318 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3687  hypothetical protein  50 
 
 		 166 aa  52  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1083  protein of unknown function DUF1214  50 
 
 		 347 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1476  protein of unknown function DUF1214  47.37 
 
 		 336 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1293  protein of unknown function DUF1214  44.64 
 
 		 345 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282416  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5466  hypothetical protein  64.29 
 
 		 375 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0734  protein of unknown function DUF1214  66.67 
 
 		 314 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>