More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1582 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
239 aa  472  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.69 
 
 
229 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3423  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.23 
 
 
234 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
234 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137706  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3196  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0271807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3437  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.28 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3218  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.33 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3471  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.33 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3450  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.28 
 
 
234 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1457  hypothetical protein  28.83 
 
 
213 aa  79  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  31.17 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0676  short chain dehydrogenase  30.54 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931099  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1526  hypothetical protein  27.07 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104801  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10130  short chain dehydrogenase  32.59 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206354  normal  0.858478 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  28.21 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3702  short chain dehydrogenase  30.42 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 
278 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.15 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
233 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3390  short chain dehydrogenase  29.05 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.29 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00144491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3129  short chain dehydrogenase  29.05 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1924  short chain dehydrogenase  31.88 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588945  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4571  short chain dehydrogenase  29.79 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000728936  hitchhiker  0.00656486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0637  short chain dehydrogenase  28.14 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000253756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0592  short chain dehydrogenase  27.27 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23035  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0632  short chain dehydrogenase  27.27 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000159867  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0670  short chain dehydrogenase  29.06 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.620328  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 
238 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0766  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.06 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.64 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
317 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 
270 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3270  short chain dehydrogenase  28.63 
 
 
226 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1384  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
233 aa  62  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.87 
 
 
233 aa  62.4  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 
224 aa  61.6  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
229 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1469  short-chain dehydrogenase/reductase  28.81 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4474  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000662369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 
252 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.9 
 
 
471 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477935  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642907  decreased coverage  0.0040913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  35.14 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1675  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.23 
 
 
472 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.438072 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3921  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 
246 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05445  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  29.08 
 
 
227 aa  60.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  27.73 
 
 
232 aa  60.1  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.77 
 
 
217 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
262 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 
232 aa  60.1  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.72 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 
252 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.73 
 
 
232 aa  60.1  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
268 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.49 
 
 
233 aa  59.3  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.138611  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
268 aa  59.3  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
227 aa  58.5  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
284 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
281 aa  58.5  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.013763 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  27.64 
 
 
236 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7662  short-chain dehydrogenase  25 
 
 
250 aa  58.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  28.4 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  27.27 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.31 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  27.27 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2880  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.43 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.52 
 
 
206 aa  58.5  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07591  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  30.57 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  26.27 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0232972  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  26.89 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.62 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  27.56 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
307 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07571  short-chain dehydrogenase/reductase  26.89 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>