245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2444 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2444  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 
102 aa  202  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1324  TraR/DksA family transcriptional regulator  71.84 
 
 
139 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2535  transcriptional regulator, TraR/DksA family  75 
 
 
103 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2631  transcriptional regulator, TraR/DksA family  74.49 
 
 
103 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0800447  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3491  putative DNA-binding protein  54 
 
 
122 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0750942  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.23 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.74 
 
 
213 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4135  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.74 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.564899  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3596  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  42.31 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0534  zinc finger DksA/TraR C4-type  38.81 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781364  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3054  zinc finger, DksA/TraR C4-type  48.94 
 
 
283 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523661  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0160  dnaK suppressor protein, putative  41.18 
 
 
120 aa  52.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.532233  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0120  dnaK suppressor protein, putative  41.18 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0934145  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0138  putative dnaK suppressor protein  41.18 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1823  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.71 
 
 
130 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00591197 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0812  transcriptional regulator  34.95 
 
 
105 aa  50.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  35.53 
 
 
117 aa  50.8  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.28 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2396  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.71 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0818179  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0382  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.46 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.63 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1198  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.22 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.114031  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2088  C4 zinc finger domain-containing protein  34.15 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000002511  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1267  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.29 
 
 
258 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120418  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0939  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0992  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.71 
 
 
257 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000149375  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0537  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.02 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.458636  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0249  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.17 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.534414  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1754  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.82 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000650821  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3710  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.79 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.324918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.51 
 
 
216 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3066  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.98 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.94 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2533  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.41 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0895997  normal  0.563175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6416  transcriptional regulator, TraR/DksA family  47.17 
 
 
120 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0580522  hitchhiker  0.0061347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0072  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.32 
 
 
140 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000740961  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3208  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.75 
 
 
218 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000145805  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1171  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.43 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37100  DnaK suppressor protein  32 
 
 
129 aa  47.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  47.92 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.86 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2447  hypothetical protein  30.3 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000244827  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.62 
 
 
253 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1263  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.78 
 
 
176 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0152  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.81 
 
 
114 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2439  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.71 
 
 
115 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.734932  normal  0.693819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1030  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.81 
 
 
527 aa  47  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00152227  hitchhiker  0.0090317 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0676  hypothetical protein  38.33 
 
 
138 aa  47  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16480  DnaK suppressor protein  40.74 
 
 
236 aa  47  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266038  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1232  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.182051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3752  putative suppressor protein DnaK  40.35 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3206  dnaK suppressor protein, putative  33.33 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000255465  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.67 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0180  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.09 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000132063  normal  0.0556483 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1158  hypothetical protein  46.3 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.22 
 
 
275 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1063  DnaK suppressor protein  40.38 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00483953  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2345  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.65 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.23 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0100  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1313  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.35 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2384  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.18 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.68054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1290  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.62 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1697  TraR/DksA family transcriptional regulator  31 
 
 
234 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.389898  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4693  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  32.97 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000772708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.97 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195272  hitchhiker  0.00000457182 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0007  hypothetical protein  41.67 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.807913  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3327  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.19 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1697  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.93 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000137678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0866  TraR/DksA family transcriptional regulator  50 
 
 
251 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0615  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.29 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1363  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.96 
 
 
205 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000285999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0565  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.83 
 
 
269 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3429  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.58 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  decreased coverage  0.00561367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.72 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0715  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.05 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000696876  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3203  zinc finger, DksA/TraR C4-type  39.58 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0401  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.07 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000019993  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.63 
 
 
158 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0008  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.47 
 
 
120 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0752856 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0741  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.97 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000053151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.13 
 
 
210 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  24.77 
 
 
212 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1413  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.36 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3190  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.55 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0162  DnaK suppressor protein  46.34 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225781  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3682  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.594064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0188  hypothetical protein  47.92 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2024  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  48.89 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812974  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1419  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  48.89 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3620  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.58 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640003  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3170  RNA polymerase-binding, DksA  32.22 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000043315  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1351  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.35 
 
 
212 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1047  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  48.89 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1334  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  48.89 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3205  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  48.89 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3077  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  48.89 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2314  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  48.89 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>