133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1649 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  100 
 
 		 359 aa  721    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  70.47 
 
 		 371 aa  518  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  66.19 
 
 		 357 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  65.06 
 
 		 370 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  61.41 
 
 		 362 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  65.22 
 
 		 360 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  57.02 
 
 		 364 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  55 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  44.81 
 
 		 691 aa  319  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  46.13 
 
 		 685 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  45.86 
 
 		 685 aa  307  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  44.63 
 
 		 728 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  46.13 
 
 		 681 aa  296  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  44.81 
 
 		 728 aa  294  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  42.05 
 
 		 710 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  42.36 
 
 		 720 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  41.07 
 
 		 684 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  42.27 
 
 		 689 aa  247  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  42.22 
 
 		 707 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  41.95 
 
 		 707 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  34.51 
 
 		 955 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  31.22 
 
 		 891 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  37.39 
 
 		 574 aa  180  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  35.65 
 
 		 556 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  32.49 
 
 		 845 aa  155  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  30.68 
 
 		 560 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  30.57 
 
 		 366 aa  142  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  30.75 
 
 		 339 aa  133  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.39 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  28.53 
 
 		 339 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  28.1 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  28.1 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  28.85 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  29.46 
 
 		 341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  28.97 
 
 		 957 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  28.88 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  28.57 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  28.1 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  29.71 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  29.35 
 
 		 346 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  29.39 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  26.8 
 
 		 956 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  27.88 
 
 		 346 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  26.47 
 
 		 959 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  29.41 
 
 		 346 aa  94  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07811  hypothetical protein  30.65 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  23.86 
 
 		 4101 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  33.93 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  33.04 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54134  glutamyl-trna reductase  29.01 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0214782  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  42.73 
 
 		 456 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  32.14 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  33.94 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  25.84 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 271 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 266 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 281 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 281 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 		 266 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  31.69 
 
 		 383 aa  49.7  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  28.98 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.95 
 
 		 461 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  28.98 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  28.98 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  36.43 
 
 		 455 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  27.63 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  29.94 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3090  amino acid adenylation domain protein  23.38 
 
 		 1466 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4474  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.07 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  33.58 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  37.14 
 
 		 448 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.02 
 
 		 266 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 264 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.576998  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 		 266 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  25.4 
 
 		 431 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3031  amino acid adenylation domain protein  24.36 
 
 		 1466 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.28 
 
 		 270 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  28.19 
 
 		 414 aa  46.6  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  28.77 
 
 		 425 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.28 
 
 		 270 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 262 aa  46.6  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.511264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  25.53 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  24.46 
 
 		 421 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63890  putative short-chain dehydrogenase  39.66 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.28 
 
 		 265 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.15353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 265 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  42.37 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  28.8 
 
 		 423 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0137  glutamyl-tRNA reductase  20.09 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0618199  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2371  Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP(+))  28.72 
 
 		 293 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  26.75 
 
 		 414 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  40.68 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0355963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 		 236 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  42.37 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>