49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1634 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  716    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  93.06 
 
 		 346 aa  649    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  81.29 
 
 		 346 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  80.99 
 
 		 346 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  80.06 
 
 		 346 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  78.93 
 
 		 346 aa  574  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  78.34 
 
 		 346 aa  571  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  78.93 
 
 		 346 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  77.74 
 
 		 346 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  65.78 
 
 		 341 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.2 
 
 		 339 aa  444  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  62.91 
 
 		 339 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  61.95 
 
 		 339 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  61.13 
 
 		 340 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  61.13 
 
 		 340 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  61.72 
 
 		 340 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07811  hypothetical protein  79.58 
 
 		 191 aa  322  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07801  hypothetical protein  82.64 
 
 		 145 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.26 
 
 		 370 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.39 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.07 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  24.79 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.73 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.35 
 
 		 357 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.77 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  29.03 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.86 
 
 		 685 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.55 
 
 		 685 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.93 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  27.69 
 
 		 728 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  27.59 
 
 		 845 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  27.04 
 
 		 728 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  24.84 
 
 		 691 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  26.56 
 
 		 710 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  24.77 
 
 		 681 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  26.81 
 
 		 689 aa  66.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  25.64 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  24.49 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  24.4 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  26.83 
 
 		 707 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  27.3 
 
 		 684 aa  59.7  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  23.04 
 
 		 957 aa  59.3  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  26.46 
 
 		 707 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  26.93 
 
 		 720 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  22.76 
 
 		 955 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  23.94 
 
 		 891 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3752  glutamyl-tRNA reductase  27.34 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2015  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  30.77 
 
 		 466 aa  43.1  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2097  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  30.77 
 
 		 466 aa  42.7  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>