63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2362 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  100 
 
 
728 aa  1461    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  51.33 
 
 
685 aa  641    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  93.95 
 
 
728 aa  1394    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  51.18 
 
 
685 aa  643    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  52.23 
 
 
681 aa  616  1e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  48.14 
 
 
691 aa  602  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  41.47 
 
 
707 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  39.33 
 
 
684 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  41.04 
 
 
707 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  40.77 
 
 
720 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  37.04 
 
 
710 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  39.88 
 
 
689 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  46.31 
 
 
357 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  44.63 
 
 
359 aa  297  6e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  44.32 
 
 
370 aa  289  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  43.49 
 
 
362 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  45.33 
 
 
360 aa  280  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  43.21 
 
 
362 aa  278  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  43.25 
 
 
371 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  40.06 
 
 
364 aa  253  9.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  31.24 
 
 
955 aa  153  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  33.83 
 
 
574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0114  hypothetical protein  28.8 
 
 
302 aa  133  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0358289  hitchhiker  0.00078389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  32.76 
 
 
556 aa  128  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0112  hypothetical protein  30.23 
 
 
304 aa  127  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000282861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00720  hypothetical protein  30.25 
 
 
305 aa  127  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000877673  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0807  hypothetical protein  29.45 
 
 
302 aa  127  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00370253  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2695  hypothetical protein  27.94 
 
 
317 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  29.86 
 
 
560 aa  119  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0149  hypothetical protein  31.37 
 
 
300 aa  116  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0567257  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3630  dehydrogenase-like protein  27.88 
 
 
312 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal  0.352042 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  27.62 
 
 
845 aa  112  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  28.45 
 
 
366 aa  111  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0475  hypothetical protein  28.76 
 
 
299 aa  110  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1511  hypothetical protein  29.25 
 
 
301 aa  110  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.850305  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0587  hypothetical protein  26.06 
 
 
303 aa  108  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0873705  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1830  hypothetical protein  31.62 
 
 
304 aa  107  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.290615 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2025  hypothetical protein  29.02 
 
 
299 aa  103  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0375526  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0492  hypothetical protein  31.27 
 
 
334 aa  99.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  37.63 
 
 
891 aa  93.2  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  29.83 
 
 
957 aa  92.8  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  27.16 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  26.79 
 
 
346 aa  83.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  27.04 
 
 
339 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.63 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  27.27 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  26.38 
 
 
340 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  26.38 
 
 
340 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  26.95 
 
 
346 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  26.94 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  27.27 
 
 
341 aa  76.6  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  27.69 
 
 
346 aa  76.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  25 
 
 
339 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  26.26 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  26.26 
 
 
346 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  25.93 
 
 
346 aa  72  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  24.68 
 
 
956 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  24.18 
 
 
959 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  26.67 
 
 
346 aa  63.9  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07811  hypothetical protein  27.66 
 
 
191 aa  53.9  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4755  hypothetical protein  25.5 
 
 
408 aa  51.6  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.0689026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  26.11 
 
 
4101 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2005  hypothetical protein  24.36 
 
 
408 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375654  normal  0.0926262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>