55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1864 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  100 
 
 		 346 aa  717    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  99.42 
 
 		 346 aa  712    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  83.67 
 
 		 346 aa  617  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  80.06 
 
 		 346 aa  591  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  80.06 
 
 		 346 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  79.48 
 
 		 346 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  80.99 
 
 		 346 aa  590  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  79.19 
 
 		 346 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  81.87 
 
 		 346 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  62.87 
 
 		 339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  62.54 
 
 		 341 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  61.38 
 
 		 340 aa  441  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  61.38 
 
 		 340 aa  441  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.28 
 
 		 339 aa  442  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  62.28 
 
 		 340 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  60.18 
 
 		 339 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07811  hypothetical protein  75 
 
 		 191 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07801  hypothetical protein  80.17 
 
 		 145 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.07 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.04 
 
 		 370 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.35 
 
 		 359 aa  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.57 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  25.85 
 
 		 357 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  26.75 
 
 		 685 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  26.44 
 
 		 685 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.48 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.15 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  28.16 
 
 		 366 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  26.55 
 
 		 845 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  22.36 
 
 		 691 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  26.95 
 
 		 728 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  26.95 
 
 		 728 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  24.45 
 
 		 681 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  22.68 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  27.24 
 
 		 710 aa  73.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  27.85 
 
 		 689 aa  72.8  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  25.33 
 
 		 556 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  29.15 
 
 		 684 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  23.53 
 
 		 957 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  24.92 
 
 		 574 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  27.19 
 
 		 707 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  23.47 
 
 		 560 aa  66.2  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  26.88 
 
 		 707 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  26.25 
 
 		 720 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  22.38 
 
 		 959 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  22.39 
 
 		 891 aa  47.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  22.28 
 
 		 955 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2015  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29.91 
 
 		 466 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2097  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  29.91 
 
 		 466 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2005  hypothetical protein  25.26 
 
 		 408 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375654  normal  0.0926262 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2752  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  31.63 
 
 		 478 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0927232  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  22.71 
 
 		 956 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0499  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  26.02 
 
 		 468 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  33.72 
 
 		 481 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2377  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  30.36 
 
 		 485 aa  42.7  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.913153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>