More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1087 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  93.46 
 
 		 382 aa  738    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  90.05 
 
 		 382 aa  717    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  81.27 
 
 		 379 aa  651    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 382 aa  775    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  57.97 
 
 		 383 aa  438  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  44.06 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  36.56 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0523  glutamyl-tRNA reductase  36.67 
 
 		 424 aa  241  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.467395  normal  0.599346 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  43.96 
 
 		 411 aa  241  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  38.44 
 
 		 464 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  39.4 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  36.39 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  35.88 
 
 		 434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  34.46 
 
 		 424 aa  233  5e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  38.22 
 
 		 434 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.88 
 
 		 464 aa  232  9e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0510  glutamyl-tRNA reductase  37.02 
 
 		 421 aa  230  3e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  36.24 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  35.48 
 
 		 434 aa  222  9e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  34.61 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2562  glutamyl-tRNA reductase  35.86 
 
 		 424 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  34.36 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  37.29 
 
 		 441 aa  209  8e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  37.18 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  33.7 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3246  glutamyl-tRNA reductase  34.36 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  36.26 
 
 		 442 aa  200  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  32.4 
 
 		 422 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  31.66 
 
 		 441 aa  199  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  35.38 
 
 		 446 aa  199  9e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1612  glutamyl-tRNA reductase  34.63 
 
 		 447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.284753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  33.15 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  32.61 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  34.17 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1219  glutamyl-tRNA reductase  31.35 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  35.16 
 
 		 458 aa  192  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  33.87 
 
 		 454 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  32.23 
 
 		 443 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  31.71 
 
 		 420 aa  190  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  33.53 
 
 		 422 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  32.39 
 
 		 418 aa  189  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  31.97 
 
 		 446 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.75 
 
 		 429 aa  189  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1538  glutamyl-tRNA reductase  33.16 
 
 		 426 aa  188  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000572654  hitchhiker  0.00320604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  33.53 
 
 		 426 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  33.24 
 
 		 422 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  34.97 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  29.8 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  31.65 
 
 		 428 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  31.65 
 
 		 428 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  33.62 
 
 		 440 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  30.05 
 
 		 420 aa  186  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  30.25 
 
 		 432 aa  186  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  30.89 
 
 		 438 aa  186  8e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  33.14 
 
 		 438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2913  glutamyl-tRNA reductase  31.59 
 
 		 416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000048664  normal  0.480262 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0810  glutamyl-tRNA reductase  32.15 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  31.79 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  32.08 
 
 		 425 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1516  glutamyl-tRNA reductase  32.56 
 
 		 426 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  33.62 
 
 		 442 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  29.85 
 
 		 416 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2567  glutamyl-tRNA reductase  30.62 
 
 		 416 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000152956  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  31.57 
 
 		 443 aa  182  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  31.57 
 
 		 443 aa  182  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  32.08 
 
 		 425 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.9 
 
 		 461 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  31.11 
 
 		 422 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  33.24 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  32.37 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  33.43 
 
 		 424 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1043  glutamyl-tRNA reductase  31.13 
 
 		 421 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  34.36 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  34.36 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  31.06 
 
 		 428 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  33.63 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  32.46 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  30.65 
 
 		 416 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  30.39 
 
 		 416 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  34.36 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  29.6 
 
 		 416 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  32.27 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  31.11 
 
 		 418 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  34.36 
 
 		 444 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  34.36 
 
 		 444 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  34.36 
 
 		 444 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  31.11 
 
 		 418 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  34.36 
 
 		 444 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  34.36 
 
 		 444 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  31.11 
 
 		 418 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  31.11 
 
 		 418 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3686  glutamyl-tRNA reductase  31.13 
 
 		 416 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  0.509552 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  31.11 
 
 		 434 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3460  glutamyl-tRNA reductase  30.6 
 
 		 426 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000782916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  34.05 
 
 		 443 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  31.03 
 
 		 421 aa  179  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  31.81 
 
 		 432 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2437  glutamyl-tRNA reductase  31.11 
 
 		 418 aa  179  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000304893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  30.65 
 
 		 416 aa  179  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1691  glutamyl-tRNA reductase  31.11 
 
 		 418 aa  179  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000277643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>