265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0989 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  100 
 
 
556 aa  1101    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  73.15 
 
 
574 aa  795    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  59.93 
 
 
560 aa  624  1e-177  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.79 
 
 
371 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  35.65 
 
 
359 aa  162  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  35.17 
 
 
370 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.58 
 
 
362 aa  157  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.17 
 
 
357 aa  147  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  31.12 
 
 
362 aa  144  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.48 
 
 
360 aa  144  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.14 
 
 
364 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.15 
 
 
691 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.63 
 
 
685 aa  134  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.93 
 
 
685 aa  134  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.34 
 
 
681 aa  130  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  32.76 
 
 
728 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  32.56 
 
 
728 aa  126  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  30.1 
 
 
684 aa  104  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  31.25 
 
 
689 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  30.41 
 
 
710 aa  99.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  26.49 
 
 
957 aa  97.4  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  30.12 
 
 
707 aa  93.6  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  29.29 
 
 
707 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  29.2 
 
 
720 aa  90.9  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  35.18 
 
 
195 aa  89.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  24.57 
 
 
891 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  29.89 
 
 
845 aa  84  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  29.26 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  26.78 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  27.97 
 
 
339 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  25.67 
 
 
956 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  25.67 
 
 
959 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  30.29 
 
 
210 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  25.99 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  33.51 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  26.43 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  25.75 
 
 
346 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  34.33 
 
 
195 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  29.86 
 
 
198 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  30.54 
 
 
198 aa  72.4  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  31.1 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0740  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  31.65 
 
 
212 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  25.66 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.7 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.07 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001618  acyl-phosphate:glycerol-3-phosphate O-acyltransferase PlsY  32.06 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0411697  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  25.42 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1945  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.42 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  26.71 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2556  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.42 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477971  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  25.33 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2580  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  31.96 
 
 
208 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  35.29 
 
 
203 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  29.38 
 
 
198 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  25.66 
 
 
346 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  31.84 
 
 
200 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  32.99 
 
 
205 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  32.38 
 
 
216 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0918  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.96 
 
 
203 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0914  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.96 
 
 
203 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0051  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  31.19 
 
 
208 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00859928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1070  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.96 
 
 
203 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3380  membrane protein  34.67 
 
 
195 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000102812  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0917  protein of unknown function DUF205  28.5 
 
 
191 aa  68.9  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.77 
 
 
215 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2604  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.02 
 
 
212 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  30 
 
 
203 aa  69.3  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0729  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.08 
 
 
202 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0121  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.49 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0372  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.49 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2507  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.49 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0672  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.49 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2475  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.56 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0301507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  26.71 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  26.71 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  32 
 
 
205 aa  67  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  36.76 
 
 
210 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.36 
 
 
203 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5888  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.24 
 
 
212 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  29.44 
 
 
195 aa  66.2  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  30.91 
 
 
226 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  31.34 
 
 
204 aa  65.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2417  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.08 
 
 
207 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  31.63 
 
 
200 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0575  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  30.62 
 
 
202 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0172  membrane protein  33.51 
 
 
200 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  32.23 
 
 
224 aa  65.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  31.88 
 
 
198 aa  65.1  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1025  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.05 
 
 
207 aa  64.7  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.942008  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3022  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.25 
 
 
194 aa  64.7  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.86 
 
 
196 aa  64.3  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.01 
 
 
194 aa  63.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2823  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.08 
 
 
207 aa  63.9  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2546  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.82 
 
 
207 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0104  membrane protein  30.96 
 
 
223 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  28.76 
 
 
226 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  29.17 
 
 
200 aa  63.2  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  37.19 
 
 
201 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.19 
 
 
201 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  33.18 
 
 
219 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>