50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2279 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  702    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.42 
 
 		 339 aa  599  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  81.12 
 
 		 339 aa  599  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  77.58 
 
 		 340 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  74.26 
 
 		 340 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  74.26 
 
 		 340 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  69.32 
 
 		 341 aa  517  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  62.24 
 
 		 346 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  62.24 
 
 		 346 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  61.95 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  60.47 
 
 		 346 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  60.18 
 
 		 346 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  63.13 
 
 		 346 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  61.65 
 
 		 346 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  60.77 
 
 		 346 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  60.77 
 
 		 346 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07811  hypothetical protein  60.44 
 
 		 191 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07801  hypothetical protein  58.54 
 
 		 145 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.75 
 
 		 359 aa  133  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.3 
 
 		 371 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.35 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.68 
 
 		 362 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.9 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  26.81 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.61 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.94 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  26.52 
 
 		 685 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  26.52 
 
 		 685 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  28.2 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  27.04 
 
 		 728 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  26.73 
 
 		 728 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  24.36 
 
 		 691 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  25.79 
 
 		 689 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  24.84 
 
 		 681 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  26.12 
 
 		 845 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  24.55 
 
 		 710 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  27.15 
 
 		 574 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  25.16 
 
 		 684 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  26.71 
 
 		 556 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  24.84 
 
 		 560 aa  67.4  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  23.29 
 
 		 707 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  22.91 
 
 		 891 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  23.6 
 
 		 720 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  23.34 
 
 		 707 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  20.73 
 
 		 957 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  31.06 
 
 		 955 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  25.56 
 
 		 956 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  25.56 
 
 		 959 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0942  glutamyl-tRNA reductase  28.22 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 250 aa  42.7  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>