69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0115 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  100 
 
 		 364 aa  745    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  57.02 
 
 		 359 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  56.06 
 
 		 371 aa  442  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  57.82 
 
 		 362 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  57.75 
 
 		 357 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  58.03 
 
 		 370 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  57.39 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  53.22 
 
 		 362 aa  361  9e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  39.12 
 
 		 691 aa  272  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  37.95 
 
 		 685 aa  259  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.57 
 
 		 681 aa  258  9e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  40.34 
 
 		 728 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  40.06 
 
 		 728 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.12 
 
 		 685 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  37.79 
 
 		 689 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  34.14 
 
 		 710 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  33.79 
 
 		 684 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  33.96 
 
 		 720 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  33.78 
 
 		 707 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  33.24 
 
 		 707 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  29.29 
 
 		 891 aa  183  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  33.82 
 
 		 574 aa  157  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  32.58 
 
 		 845 aa  152  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  31.1 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  33.14 
 
 		 556 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  28.91 
 
 		 955 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  30.79 
 
 		 560 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  27.13 
 
 		 957 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  28.94 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  28.05 
 
 		 339 aa  116  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  27.3 
 
 		 340 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.14 
 
 		 339 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  25.93 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  25.93 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  24.59 
 
 		 956 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  24.59 
 
 		 959 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  26.03 
 
 		 346 aa  95.9  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  26.01 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  25.71 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  26.35 
 
 		 346 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  25.68 
 
 		 341 aa  91.3  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  24.84 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  26.15 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  25 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  24.53 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  25.08 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07811  hypothetical protein  26.49 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4755  hypothetical protein  23.81 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.0689026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2005  hypothetical protein  23.34 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375654  normal  0.0926262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 260 aa  50.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  21.94 
 
 		 4101 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 		 253 aa  47  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  20.22 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0646  glutamyl-tRNA reductase  27.63 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  26.09 
 
 		 383 aa  43.5  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  29.76 
 
 		 444 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  29.76 
 
 		 444 aa  43.5  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  29.76 
 
 		 444 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  29.76 
 
 		 444 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  29.76 
 
 		 444 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 258 aa  43.1  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 		 260 aa  43.1  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  29.76 
 
 		 444 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  29.76 
 
 		 444 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 		 262 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  38.18 
 
 		 255 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 		 262 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 258 aa  42.7  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00673203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  25.77 
 
 		 443 aa  42.7  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>