57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_3370 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
339 aa  704    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  91.45 
 
 
339 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  81.42 
 
 
339 aa  599  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  81.95 
 
 
340 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  80.47 
 
 
340 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  80.47 
 
 
340 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  73 
 
 
341 aa  533  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  63.77 
 
 
346 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  62.57 
 
 
346 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  62.28 
 
 
346 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  63.2 
 
 
346 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  64.69 
 
 
346 aa  438  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  62.61 
 
 
346 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  62.02 
 
 
346 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  62.02 
 
 
346 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  61.13 
 
 
346 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07811  hypothetical protein  63.33 
 
 
191 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07801  hypothetical protein  61.79 
 
 
145 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.39 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.32 
 
 
371 aa  123  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.8 
 
 
370 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.2 
 
 
362 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.43 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.41 
 
 
362 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  25 
 
 
357 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  26.14 
 
 
364 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  28.08 
 
 
689 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  25.08 
 
 
685 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  24.76 
 
 
685 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  24.41 
 
 
691 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  26.18 
 
 
845 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  25.63 
 
 
728 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  25.32 
 
 
728 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  30.04 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  23.96 
 
 
710 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  23.76 
 
 
681 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  26.76 
 
 
556 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  25.48 
 
 
684 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  26.07 
 
 
574 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  25.32 
 
 
707 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  25.32 
 
 
707 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  24.73 
 
 
560 aa  63.2  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  24.29 
 
 
720 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  21.67 
 
 
957 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  27.27 
 
 
418 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  27.81 
 
 
418 aa  49.7  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  22.73 
 
 
959 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  22.73 
 
 
956 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  28.86 
 
 
955 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  24.22 
 
 
891 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  25.48 
 
 
4101 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0942  glutamyl-tRNA reductase  28.44 
 
 
416 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1932  glutamyl-tRNA reductase  27.03 
 
 
418 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000431786  normal  0.0964629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  27.96 
 
 
418 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  27.96 
 
 
418 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  27.96 
 
 
418 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  27.96 
 
 
418 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>