65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0173 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  100 
 
 		 357 aa  726    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  66.19 
 
 		 359 aa  504  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  63.92 
 
 		 371 aa  484  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  62.82 
 
 		 370 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  59.66 
 
 		 362 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  61.45 
 
 		 360 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  57.75 
 
 		 364 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  57.66 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  46.31 
 
 		 728 aa  305  7e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  46.31 
 
 		 728 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  46.29 
 
 		 681 aa  293  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  44.57 
 
 		 685 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  44.86 
 
 		 685 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  41.76 
 
 		 691 aa  289  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  40.54 
 
 		 710 aa  245  9e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  42.86 
 
 		 689 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  40.87 
 
 		 720 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  41.37 
 
 		 707 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  40.6 
 
 		 707 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  40.66 
 
 		 684 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  31.83 
 
 		 891 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  32.91 
 
 		 955 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  32.94 
 
 		 574 aa  155  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  32.17 
 
 		 556 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  30.58 
 
 		 845 aa  146  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  29.86 
 
 		 560 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  30.48 
 
 		 366 aa  139  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  29.81 
 
 		 957 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  27.88 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  26.81 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  26.62 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  26.62 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  26.2 
 
 		 339 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  26.36 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  27.68 
 
 		 346 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  27.4 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  27.22 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 339 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  27.68 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  26.42 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  27.3 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  26.23 
 
 		 956 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  25.85 
 
 		 346 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  26.23 
 
 		 959 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  28.35 
 
 		 346 aa  93.6  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  28.53 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2005  hypothetical protein  22.67 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375654  normal  0.0926262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4755  hypothetical protein  22.97 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.0689026 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07811  hypothetical protein  28.11 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  23.03 
 
 		 4101 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  31.03 
 
 		 448 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  25.53 
 
 		 425 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  31.16 
 
 		 456 aa  46.2  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 		 271 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.35 
 
 		 260 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  26.42 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5804  ectoine utilization protein EutC  28.77 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6168  ectoine utilization protein EutC  28.77 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 317 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 317 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  25.19 
 
 		 319 aa  43.5  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0951  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 		 268 aa  43.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6019  ectoine utilization protein EutC  28.17 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 		 270 aa  42.7  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5775  ectoine utilization protein EutC  28.17 
 
 		 334 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0743164  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>