More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5696 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 448 aa  886    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  55.56 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  53.66 
 
 		 455 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  48.74 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  49.77 
 
 		 447 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  49.33 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  49.77 
 
 		 447 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  49.77 
 
 		 447 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  49.2 
 
 		 456 aa  359  6e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  50 
 
 		 443 aa  353  4e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  46.68 
 
 		 435 aa  344  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  47.69 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  48.34 
 
 		 440 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  52.26 
 
 		 438 aa  341  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  48.71 
 
 		 434 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  47.46 
 
 		 458 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  48.37 
 
 		 457 aa  327  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  47.71 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  42.37 
 
 		 477 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  46.68 
 
 		 430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  42.12 
 
 		 501 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  44.02 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  43.52 
 
 		 473 aa  303  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  43.99 
 
 		 476 aa  300  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  48.93 
 
 		 442 aa  300  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  44.84 
 
 		 456 aa  295  1e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 464 aa  249  9e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  38.97 
 
 		 436 aa  245  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  34.28 
 
 		 458 aa  239  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  39.01 
 
 		 446 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.92 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  36.56 
 
 		 454 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  32.32 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  33.96 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  34.04 
 
 		 443 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  33.73 
 
 		 428 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  33.73 
 
 		 428 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  34.2 
 
 		 434 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 428 aa  228  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  33.25 
 
 		 434 aa  229  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  28.91 
 
 		 441 aa  227  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  34.62 
 
 		 434 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 444 aa  226  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  37.14 
 
 		 458 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  36.1 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  33.72 
 
 		 444 aa  225  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  33.41 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  32.79 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  32.7 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 		 434 aa  221  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  33.89 
 
 		 443 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  34.46 
 
 		 443 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  34.44 
 
 		 421 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  32.23 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  34.47 
 
 		 438 aa  216  8e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  35.83 
 
 		 451 aa  215  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 		 461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  31.68 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  34.99 
 
 		 453 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  35.39 
 
 		 425 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  32.23 
 
 		 442 aa  206  7e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  32.63 
 
 		 432 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  33.94 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  31.16 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  32.28 
 
 		 465 aa  203  4e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  32.35 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  31.4 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 		 416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  31.28 
 
 		 440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  33.81 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  32.3 
 
 		 418 aa  195  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26740  glutamyl-tRNA reductase  34.61 
 
 		 500 aa  192  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  30.7 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  31.24 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  30.93 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  30.3 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  31.34 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  30.96 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  29.25 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  29.25 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08151  glutamyl-tRNA reductase  28.67 
 
 		 435 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.374123  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 440 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  33 
 
 		 425 aa  189  7e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 443 aa  189  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  33.33 
 
 		 443 aa  189  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  35.42 
 
 		 473 aa  188  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  29.14 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  31.35 
 
 		 418 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  29.37 
 
 		 436 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  32.03 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  33.73 
 
 		 446 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>