62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0872 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 340 aa  703    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  100 
 
 		 340 aa  703    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  81.66 
 
 		 339 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.47 
 
 		 339 aa  579  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  78.7 
 
 		 340 aa  567  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  74.26 
 
 		 339 aa  541  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  69.44 
 
 		 341 aa  510  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  61.38 
 
 		 346 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  63.5 
 
 		 346 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  63.5 
 
 		 346 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  63.2 
 
 		 346 aa  437  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  61.38 
 
 		 346 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  62.87 
 
 		 346 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  62.02 
 
 		 346 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  61.13 
 
 		 346 aa  430  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  62.02 
 
 		 346 aa  424  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07811  hypothetical protein  66.67 
 
 		 191 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07801  hypothetical protein  55.28 
 
 		 145 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.75 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.51 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.1 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  26.62 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  26.21 
 
 		 371 aa  109  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  28.16 
 
 		 360 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  28.84 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  26.38 
 
 		 362 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.17 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  25.57 
 
 		 685 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  27.94 
 
 		 689 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  25.24 
 
 		 685 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  24.83 
 
 		 691 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  25.93 
 
 		 681 aa  83.2  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  26.38 
 
 		 728 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  26.62 
 
 		 728 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  25.32 
 
 		 845 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  25.87 
 
 		 710 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  27.03 
 
 		 574 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  26.71 
 
 		 556 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  25 
 
 		 707 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  25.95 
 
 		 707 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  28 
 
 		 684 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  21.41 
 
 		 891 aa  62.8  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  24.13 
 
 		 720 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  29.32 
 
 		 957 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2115  glutamyl-tRNA reductase  29.21 
 
 		 418 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.435842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2408  glutamyl-tRNA reductase  29.78 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  28.57 
 
 		 955 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  22.34 
 
 		 956 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  22.29 
 
 		 959 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0942  glutamyl-tRNA reductase  31.19 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4755  hypothetical protein  23.41 
 
 		 408 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.0689026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3752  glutamyl-tRNA reductase  30.7 
 
 		 434 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1374  glutamyl-tRNA reductase  29.94 
 
 		 418 aa  43.1  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000847987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1358  glutamyl-tRNA reductase  29.94 
 
 		 418 aa  43.1  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000645666  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03645  glutamyl-tRNA reductase  28.75 
 
 		 422 aa  43.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01195  hypothetical protein  29.94 
 
 		 418 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0924296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2416  glutamyl-tRNA reductase  29.94 
 
 		 418 aa  43.1  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000119078  hitchhiker  0.0000345051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  26.88 
 
 		 4101 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1315  glutamyl-tRNA reductase  29.94 
 
 		 418 aa  43.1  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.01079e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01185  glutamyl-tRNA reductase  29.94 
 
 		 418 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112965  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0951  glutamyl-tRNA reductase  27.46 
 
 		 425 aa  42.7  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2071  glutamyl-tRNA reductase  27.98 
 
 		 418 aa  42.7  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0132375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>